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Enregistrement W2886303958 · doi:10.1158/1538-7445.am2018-sy28-01

Abstract SY28-01: Management of MAP kinase and apoptosis signaling thresholds by microRNAs

2018· article· en· W2886303958 sur OpenAlexaff
W. Brent Derry

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMechanisms of cancer metastasis
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologymicroRNACaenorhabditis elegansCell biologyApoptosisKinaseMAPK/ERK pathwaySignal transductionEffectorTranslation (biology)GeneticsGeneMessenger RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract An important problem in cancer biology is concerned with how apoptotic thresholds are established. Defective regulation of apoptosis can cause resistance to chemotherapeutic agents and radiation therapy, which highlights the need to resensitize these tumors to therapy. The apoptosis pathway was first elucidated in the roundworm Caenorhabditis elegans, and studies in this organism continue to uncover regulatory mechanisms that are also conserved in humans. By taking advantage of the powerful genetics, cell biology, and proteomics tools of C. elegans, we seek to understand how apoptotic signaling is fine-tuned in response to ionizing radiation (IR). Our work has uncovered a network of regulatory mechanisms, such as ubiquitin proteolysis and microRNAs, that control the levels of apoptotic proteins. I will discuss our recent efforts to understand how microRNA 35 (mir-35) antagonizes translation of the BH3-only protein EGL-1 and the Ras/MAPK effector NDK-1 in response to IR. EGL-1 is homologous to human PUMA and NDK-1 is the worm orthologue of human NME1 (NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 1), which has been shown to regulate MAPK signaling in both worms and human cells. mir-35 normally functions to buffer IR-induced apoptosis through its combinatorial effects on EGL-1 and NDK-1 translation. Ablation of mir-35, or mutations in the mir-35 binding sites in the 3'-untranslated region (3'UTR) of egl-1 and ndk-1, increase the levels of these proteins and cause hypersensitivity to IR-induced apoptosis. By targeting both the core apoptosis pathway and the MAPK cascade, we propose that mir-35 plays a key role in fine-tuning apoptotic signaling in order to protect healthy cells and ensure a rapid response to DNA-damaging agents. Given the high conservation in the organization of these pathways from C. elegans to human, manipulating microRNAs might help resensitize tumors that have developed resistance to radiation and/or chemotherapy. Citation Format: W. Brent Derry. Management of MAP kinase and apoptosis signaling thresholds by microRNAs [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2018; 2018 Apr 14-18; Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2018;78(13 Suppl):Abstract nr SY28-01.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,044
Score d'incertitude au seuil0,490

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,371
Écart entre enseignants0,324 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
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