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Enregistrement W2886339606 · doi:10.1158/1538-7445.am2018-1381

Abstract 1381: Targeting histone acetyltransferases to reprogram high C-MYC expressing cancers

2018· article· en· W2886339606 sur OpenAlexaff
Elodie M. Da Costa, Gregory Armaos, Annie Beaudry, Chantal Richer, Maxime Caron, Pascal St-Onge, Jeffrey R. Johnson, Nevan J. Krogan, Yuka Sai, Michael Downey, Daniel Sinnett, Serge McGraw, Noël J.‐M. Raynal

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHistone Deacetylase Inhibitors Research
Établissements canadiensEsri (Canada)Centre Hospitalier Universitaire Sainte-Justine
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEpigeneticsHistone AcetyltransferasesCancer researchHistoneBiologyHistone acetyltransferaseOncogeneChromatinAcetylationCancerCancer cellMolecular biologyGeneGeneticsCell cycle

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract In cancer, epigenetic modifications are strongly altered and are responsible for gene expression aberrations. In a drug screening initiative, we recently reported that proscillaridin, a cardiac glycoside (CG), exhibits unsuspected epigenetic and anticancer activities. To understand CG's epigenetic mechanisms of action, we performed RNA sequencing analysis, which showed proscillaridin effects on global gene expressions in acute lymphoblastic leukemia cells (MOLT-4). Genes associated with apoptosis and cell differentiation were upregulated whereas master transcription factors and oncogenic pathway genes were downregulated. Mechanistic studies revealed that proscillaridin decreased histone 3 acetylation, which correlated with histone acetyltransferase (KATs) downregulation (CBP, P300, TIP60, GCN5 and MOZ). Acetylome studies by mass spectrometry showed an acetylation loss in chromatin regulators, the oncogene C-MYC and its associated proteins. Proscillaridin induced C-MYC transcript and protein degradation. Moreover, in a panel of cancer cell lines, we measured that cancer cells sensitivity to proscillaridin treatment was positively correlated with C-MYC protein levels. Conversely, proscillaridin did not affect C-MYC protein level in low C-MYC expressing cancer cell lines. For the first time, we showed that CGs target histone acetyltransferases and C-MYC oncogene in high C-MYC expressing cancers. We propose that CGs can be repurposed as new epigenetic drugs in high C-MYC expressing cancers. Citation Format: Elodie M. Da Costa, Gregory Armaos, Annie Beaudry, Chantal Richer, Maxime Caron, Pascal St-Onge, Jeffrey Johnson, Nevan Krogan, Yuka Sai, Michael Downey, Daniel Sinnett, Serge McGraw, Noël J. Raynal. Targeting histone acetyltransferases to reprogram high C-MYC expressing cancers [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2018; 2018 Apr 14-18; Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2018;78(13 Suppl):Abstract nr 1381.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,426
Écart entre enseignants0,376 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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