The Great Lakes Region is a melting pot for vicariant red fox (Vulpes vulpes) populations
Notice bibliographique
Résumé
During the Pleistocene, red fox (Vulpes vulpes) populations in North America were isolated in glacial refugia and diverged into 3 major lineages: the Nearctic-Eastern subclade of eastern Canada, the Nearctic-Mountain subclade of the western mountains, and the Holarctic clade of Alaska. Following glacial retreats, these genetically distinct populations of foxes expanded into newly available habitat. Along with subsequent translocation from fur farms, these expansions have resulted in red foxes now occupying most of the continent. The origin of foxes that colonized the Great Lakes Region, however, remains unknown. Furthermore, it is unclear whether contemporary populations inhabiting this region are the result of natural range expansion or if foxes released from fur farms colonized the landscape in the 1900s. To determine the origin of red foxes in the Great Lakes Region, we collected genetic samples from 3 groups: 1) contemporary wild foxes, 2) historical wild foxes collected before fur farming, and 3) fur-farmed foxes from a contemporary fur farm. We constructed a network of mtDNA haplotypes to identify phylogeographic relationships between the 3 sample groups, and examined genetic signatures of fur-farmed foxes via the androgen receptor gene (AR) associated with tame phenotypes. Historical wild foxes demonstrated natural colonization from all 3 major North American lineages, which converged within the Great Lakes Region, and contemporary wild foxes maintained the historically high genetic diversity. Most contemporary wild foxes also matched haplotypes of fur-farmed foxes; however, AR was not useful in distinguishing fur-farm origins in samples of contemporary wild foxes. Our results show that geographically disparate populations naturally merged in the Great Lakes Region before fur-farmed foxes were introduced. Due to the historically high genetic diversity in the Great Lakes Region, any introductions from fur farms likely contributed to, but did not create, the genetic structure observed in this region.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».