Notice bibliographique
Résumé
Abstract DICER1 is an endoribonuclease central to generating microRNAs (miRNAs), small RNA molecules that downregulate the expression of approximately 30% of protein-coding genes. Germ-line mutations in DICER1 have been identified in patients afflicted with a pleiotropic tumor predisposition syndrome, usually referred to as DICER1 syndrome (OMIM 606241). DICER1 syndrome is thought to originate from a mesenchymal cell bearing a frameshift or nonsense mutation on one allele and a missense mutation affecting the RNase IIIb domain on the other allele. While interest in the role of DICER1 in normal development and pathogenesis has been explored in both the knockout and overexpression context, neither situation is relevant for understanding DICER1 syndrome. We hypothesize that defective DICER1 protein production in a mesenchymal stem cell at a critical time in development leads to altered miRNA populations that, in turn, initiate or prime cells for tumorigenesis. The goal of this study was to develop and characterize a model of the putative tumor-initiating cell namely a mesenchymal stromal cell (MSC) bearing a DICER1 RNase IIIb mutation. SV-40 immortalized mouse mesenchymal stromal cells (MSCs) containing a homozygous floxed exon for DICER1 were ex vivo cre inactivated to produce Dicer-/- MSCs. Into these Dicer-/- MSCs, a FLAG-tagged human DICER1, a FLAG-tagged RNase IIIa mutant DICER1, and a FLAG-tagged RNase IIIb mutant DICER1 were stably introduced. Cells were characterized by Western blot in response to serum starvation and stimulation. Their ability to form anchorage-independent colonies was assessed by soft agar assay pre- and post-oncogene introduction. Transcriptomes were interrogated by gene expression microarray. Results: Alterations in protein expression were observed in cells in response to starvation and stimulation. Certain cell lines were able to produce anchorage-independent colonies. Conclusions: We have created MSCs bearing RNase IIIb-mutated DICER1 to model DICER1 syndrome. We suggest that the ability for an MSC to produce only 3p miRNAs in the presence of an oncogene can allow for anchorage-independent growth. Citation Format: Mona K. Wu. Modeling DICER1 syndrome in cells [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2018; 2018 Apr 14-18; Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2018;78(13 Suppl):Abstract nr 3107.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».