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Enregistrement W2886543388 · doi:10.1158/1538-7445.am2018-2652

Abstract 2652: Metabolomics biomarkers for endometrial cancer and its recurrence after surgery in postmenopausal women

2018· article· en· W2886543388 sur OpenAlexaff
Yannick Audet-Delage, Jean‐Pierre Grégoire, Marie Plante, Chantal Guillemette

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Lipids, and Metabolism
Établissements canadiensUniversité LavalCentre hospitalier universitaire de Québec
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEndometrial cancerMetabolomicsMedicineBiomarkerSerous fluidInternal medicineCancerMetaboliteGastroenterologyOncologyPhysiologyBiologyBioinformaticsBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Endometrial cancer (EC) is the most frequent cancer of the female genital tract in developed countries. Most EC occurs after menopause and are diagnosed as endometrioid type I carcinomas that exhibit a favorable prognosis especially for grades 1 and 2. In contrast, type II non-endometrioid carcinomas such as serous tumors have a poor prognosis. The use of small molecule biomarkers may facilitate accurate diagnosis and prognostic predictions. Our goal was to identify novel blood-based markers associated with EC subtypes and recurrence after surgery in postmenopausal women. Using mass spectrometry (MS)-based metabolomics, we examined preoperative serum metabolites of healthy women (n=18), non-recurrent and recurrent cases with type I endometrioid (n=24) and type II serous (n=12) carcinomas, matched for pathological characteristics, body mass index and age. Biochemicals including complex lipids were analyzed by gas chromatography-MS and ultrahigh performance liquid chromatography-tandem MS. A total of 1592 compounds of known identity and 14 different lipid classes were assessed. When comparing EC cases to healthy women, 137 metabolites were significantly different, with spermine as the most altered biochemical, identifying this metabolite as a potential biomarker of EC. Furthermore, recurrent cases of both histological types had higher levels of the monoacylglycerol 1-oleoylglycerol than non-recurrent cases. Type I recurrent cases were also characterized by much lower levels of bile acids and elevated concentrations of phosphorylated fibrinogen cleavage peptide, whereas type II recurrent cases displayed higher levels of ceramides and their derivatives. Our findings provide a first detailed metabolomics study in EC and identify potential non-invasive biomarkers to define clinically relevant risk groups. Citation Format: Yannick Audet-Delage, Lyne Villeneuve, Jean Grégoire, Marie Plante, Chantal Guillemette. Metabolomics biomarkers for endometrial cancer and its recurrence after surgery in postmenopausal women [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2018; 2018 Apr 14-18; Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2018;78(13 Suppl):Abstract nr 2652.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,382
Écart entre enseignants0,324 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
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