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Enregistrement W2886987556 · doi:10.1158/1538-7445.am2018-1562

Abstract 1562: Clusters of circulating tumor cells were selectively isolated in the blood of 12/12 epithelial ovarian cancer patients using facile gravity-flow-based filtration method adapted to clinical use

2018· article· en· W2886987556 sur OpenAlexaff
Anne Meunier, Sara Kheireddine, Javier Alejandro Hernández-Castro, Benjamin Péant, Diane Provencher, Anne‐Marie Mes‐Masson, Teodor Veres, David Juncker

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Cells and Metastasis
Établissements canadiensNational Research Council CanadaUniversité de MontréalMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCirculating tumor cellOvarian cancerEpithelial ovarian cancerFiltration (mathematics)MetastasisCluster (spacecraft)CancerCancer researchLimitingInternal medicineBiologyOncologyMedicineComputer scienceMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background The presence of circulating tumor cells (CTCs) in blood is correlated with disease progression in many cancers. Their prognosis value in ovarian cancer is still under debate.1 CTCs are heterogeneous in size and marker expression, and sub-populations with various metastatic potentials have been identified. CTC clusters, although rare and difficult to isolate, have emerged as a possible driver of metastasis owing to ~50-time higher metastatic potential than single CTCs.2 Only few methods have emerged to capture clusters, and are often complex and cumbersome, limiting our understanding of the role of clusters in metastasis. Here, we present a new filtration method for the selective capture of CTC clusters from blood and found clusters in 12/12 epithelial ovarian cancer (EOC) patients. Method Cluster capture was performed by filtration using a 3D printed cartridge3 and filters4 with pore diameters of 8, 10, 12, 15, 20 or 28 μm. We developed a gravity-driven process, generating reduced shear stress, and optimized capture using blood (1:6, v/v, in PBS) spiked with OV-90 and OVCAR-3 ovarian cancer single cells and clusters. Blood samples from 12 EOC patients were filtered. Clusters can be stained and imaged on the filter, or released for downstream analysis. Results Using the gravity-setup, we were able to selectively capture clusters with good integrity and with a rate that outperforms other technologies to the best of our knowledge. Viable CTC clusters, with 2 to >100 cells, were captured from 12/12 EOC patients. Their size distribution was surprisingly similar between patients. Small clusters (2-3 cells) were the most frequent, and this frequency decreased as their size increased. The molecular characterization of the captured clusters revealed a low and localized, heterogeneous expression of EpCAM (epithelial cell adhesion molecule), in combination with a widespread expression of c-MET (hepatocyte growth factor receptor) in all patients, suggesting a mesenchymal-like profile. Conclusion Using the gravity-filtration setup, CTC clusters were captured from the blood of all patients tested, suggesting that clusters are much more widespread than anticipated, and are in fact the norm rather than the exception. The cluster size distribution was conserved between patients with small clusters dominating, and some rare, very large clusters. Cluster staining revealed a mesenchymal profile, in agreement with a higher metastatic potential. Together, these results suggest that clusters should significantly contribute to disease progression, a hypothesis, which may be explored using our facile and selective method. References 1. Y. Zhou, et al. PLoS ONE 2015, 10, e0130873. 2. N. Aceto, et al. Cell 2014, 158, 1110. 3. A. Meunier, et al. Anal. Chem. 2016, 88, 8510. 4. J. A. Hernandez-Castro, et al. LOC 2017, 17, 1960 Citation Format: Anne Meunier, Sara Kheireddine, J. Alejandro Hernández-Castro, Benjamin Péant, Diane Provencher, Anne-Marie Mes-Masson, Teodor Veres, David Juncker. Clusters of circulating tumor cells were selectively isolated in the blood of 12/12 epithelial ovarian cancer patients using facile gravity-flow-based filtration method adapted to clinical use [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2018; 2018 Apr 14-18; Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2018;78(13 Suppl):Abstract nr 1562.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,176
Tête enseignante GPT0,452
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
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