Voxel-wise radiogenomic mapping of tumor location with key molecular alterations in patients with glioma
Notice bibliographique
Résumé
Background: This study aims to evaluate the impact of tumor location on key molecular alterations on a single voxel level in patients with newly diagnosed glioma. Methods: A consecutive series of n = 237 patients with newly diagnosed glioblastoma and n = 131 patients with lower-grade glioma was analyzed. Volumetric tumor segmentation was performed on preoperative MRI with a semi-automated approach and images were registered to the standard Montreal Neurological Institute 152 space. Using a voxel-based lesion symptom mapping (VLSM) analysis, we identified specific brain regions that were associated with tumor-specific molecular alterations. We assessed a predefined set of n = 17 molecular characteristics in the glioblastoma cohort and n = 2 molecular characteristics in the lower-grade glioma cohort. Permutation adjustment (n = 1000 iterations) was used to correct for multiple testing, and voxel t-values that were greater than the t-value in >95% of the permutations were retained in the VLSM results (α = 0.05, power > 0.8). Results: Tumor location predilection for isocitrate dehydrogenase (IDH) mutant tumors was found in both glioblastoma and lower-grade glioma cohorts, each showing a concordant predominance in the frontal lobe adjacent to the rostral extension of the lateral ventricles (permutation-adjusted P = 0.021 for the glioblastoma and 0.013 for the lower-grade glioma cohort). Apart from that, the VLSM analysis did not reveal a significant association of the tumor location with any other key molecular alteration in both cohorts (permutation-adjusted P > 0.05 each). Conclusion: Our study highlights the unique properties of IDH mutations and underpins the hypothesis that the rostral extension of the lateral ventricles is a potential location for the cell of origin in IDH-mutant gliomas.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».