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Enregistrement W2887237327 · doi:10.1158/1538-7445.am2018-773

Abstract 773: A heterochromatin gene signature unveils HP1α mediating neuroendocrine prostate cancer development and aggressiveness

2018· article· en· W2887237327 sur OpenAlexaff
Xinpei Ci, Jun Hao, Xin Dong, Stephen Yiu Chuen Choi, Hui Xue, Sifeng Qu, Ladan Fazli, Francesco Crea, Christopher J. Ong, Amina Zoubeidi, Housheng Hansen He, Martin Gleave, Colin C. Collins, Dong Lin, Yuzhuo Wang

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Treatment and Research
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyTransdifferentiationHeterochromatinCancer researchHistoneProstate cancerEctopic expressionLNCaPGene silencingCell biologyChromatinGeneticsGeneCancerCell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Neuroendocrine prostate cancer (NEPC) is a lethal subtype of prostate cancer (PCa) arising mostly from adenocarcinoma via NE transdifferentiation following androgen deprivation therapy. However, mechanisms contributing to both NEPC development and its aggressiveness remain elusive. In light of the fact that hyperchromatic nuclei is a distinguishing histopathological feature of NEPC, we identified 36 heterochromatin-related genes that are significantly enriched in NEPC by transcriptomic analyses of our patient-derived xenograft (PDX) models, multiple clinical cohorts, and genetically engineered mouse models. Longitudinal analysis using our unique, first-in-field PDX model of adenocarcinoma-to-NEPC transdifferentiation revealed that, among those 36 heterochromatin-related genes, heterochromatin protein 1α (HP1α) expression is increased early and steadily during NEPC development and remain elevated in the developed NEPC tumor. Its elevated expression is further confirmed in multiple PDX and clinical NEPC samples. Functional studies showed that HP1α knockdown in the NCI-H660 NEPC cell line dramatically inhibits proliferation, completely ablates colony formation, and induces apoptotic cell death, ultimately leading to tumor growth arrest. Its ectopic expression significantly promotes NE transdifferentiation in adenocarcinoma cells subjected to androgen deprivation treatment. Mechanistically, HP1α reduces expression of androgen receptor (AR) and RE1 silencing transcription factor (REST), two crucial transcription factors silenced in NEPC, and enriches the repressive histone mark trimethylation of histone H3 at Lys9 (H3K9me3) on their respective gene promoters. These observations indicate a novel mechanism underlying NEPC development mediated by abnormally expressed heterochromatin genes, with HP1α as an early functional mediator and a potential therapeutic target for NEPC prevention and/or management. Citation Format: Xinpei Ci, Jun Hao, Xin Dong, Stephen Y. Choi, Hui Xue, Sifeng Qu, Ladan Fazli, Francesco Crea, Christopher Ong, Amina Zoubeidi, Housheng H. He, Martin E. Gleave, Colin C. Collins, Dong Lin, Yuzhuo Wang. A heterochromatin gene signature unveils HP1α mediating neuroendocrine prostate cancer development and aggressiveness [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2018; 2018 Apr 14-18; Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2018;78(13 Suppl):Abstract nr 773.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,068
Tête enseignante GPT0,417
Écart entre enseignants0,349 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
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