MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2887352281 · doi:10.1111/tra.12609

Protein kinase D1 and oxysterol‐binding protein form a regulatory complex independent of phosphorylation

2018· article· en· W2887352281 sur OpenAlexafffund
Asako Goto, Mark Charman, Neale D. Ridgway

Notice bibliographique

RevueTraffic · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCholesterol and Lipid Metabolism
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesInstitute of Nutrition, Metabolism and DiabetesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyPhosphorylationCell biologyOxysterolProtein kinase AAutophagy-related protein 13Protein phosphorylationKinasePlasma protein bindingBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Protein kinase D (PKD) controls secretion from the trans-Golgi network (TGN) by phosphorylating phosphatidylinositol 4-kinase IIIβ and proteins that bind and/or transfer phosphatidylinositol 4-phosphate (PtdIns-4P), such as oxysterol-binding protein (OSBP) and ceramide transfer protein. Here, we investigated the consequences of PKD phosphorylation of OSBP at endoplasmic reticulum (ER)-Golgi membrane contact sites (MCS). Results with OSBP phospho-mutants revealed that PKD phosphorylation did not affect sterol and PtdIns-4P binding, activation of sphingomyelin (SM) synthesis at Golgi-ER MCS or other OSBP phospho-sites. Instead, an interaction was identified between the N-terminal region of OSBP and PKD1 that was independent of kinase activity and OSBP phosphorylation status. S916 autophosphorylation of PKD1 was inhibited by OSBP expression suggesting the interaction negatively regulates PKD1 activity. Stimulation of PKD1 activity by phorbol ester promoted the Golgi-localization of wild-type and phospho-mutants of OSBP but did not affect OSBP-dependent SM synthesis. Only when wild-type or kinase-dead PKD1 was overexpressed was 25-hydroxycholesterol-activated SM synthesis inhibited. We conclude that OSBP and PKD1 form a complex that inhibits both the oxysterol-dependent activity of OSBP at the ER-Golgi and activation of PKD1. Formation of the complex was independent of PKD1 activity and phosphorylation of OSBP.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,482
Score d'incertitude au seuil0,531

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueTrafficMême sujetCholesterol and Lipid MetabolismTravaux en français237 207