Organization and evolution of two repetitive sequences, 18-24J and 12-13P, in the genome of <i>Chenopodium</i> (Amaranthaceae)
Notice bibliographique
Résumé
The abundance and chromosomal organization of two repetitive sequences named 12-13P and 18-24J were analyzed in 24 diploid and nine polyploid species of Chenopodium s.l., with special attention to Chenopodium s.s. Both sequences were predominantly present in species of Chenopodium s.s.; however, differences in the amplification levels were observed among the species. The 12-13P repeat was highly amplified in all of the analyzed Eurasian species, whereas the American diploids showed a marked variation in the amplification levels. The 12-13P repeat contains a tandemly arranged 40 bp minisatellite element forming a large proportion of the genome of Chenopodium (up to 3.5%). FISH revealed its localization to the pericentromeric regions of the chromosomes. The chromosomal distribution of 12-13P delivered additional chromosomal marker for B-genome diploids. The 18-24J repeat showed a dispersed organization in all of the chromosomes of the analyzed diploid species and the Eurasian tetraploids. In the American allotetraploids (C. quinoa, C. berlandieri) and Eurasian allohexaploids (e.g., C. album) very intense hybridization signals of 18-24J were observed only on 18 chromosomes that belong to the B subgenome of these polyploids. Combined cytogenetic and molecular analyses suggests that reorganization of these two repeats accompanied the diversification and speciation of diploid (especially A genome) and polyploid species of Chenopodium s.s.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».