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Enregistrement W2887481047 · doi:10.1139/gen-2018-0042

Characterization of the GATA gene family in <i>Vitis vinifera</i>: genome-wide analysis, expression profiles, and involvement in light and phytohormone response

2018· article· en· W2887481047 sur OpenAlex
Zhan Zhang, Chong Ren, Luming Zou, Yi Wang, Shaohua Li, Zhenchang Liang

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

venuePublié dans une revue dont le pays d'attache est le Canada.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueGenome · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Gene Expression Analysis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyGeneGATA transcription factorTranscription factorGeneticsGene familyAbiotic stressGene expressionGene duplicationRegulation of gene expressionCell biologyPromoter

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The plant GATA family is one of the most important transcription factors involved in light-responsive development, nitrogen metabolism, phytohormone signaling, and source/sink balance. However, the function of the GATA gene is less known in grape (Vitis vinifera L.). In this study, we comprehensively analyzed the GATA family in grape, particularly the phylogenetic evolution, duplication patterns, conserved motifs, gene structures, cis-elements, tissue expression patterns, and predicted function of VvGATA genes in response to abiotic stress. The potential roles of VvGATA genes in berry development were also investigated. The GATA transcription factors displayed expression diversity among different grape organs and tissues, and some of them showed preferential expression in a specific tissue. Heterotrophic cultured cells were used as model systems for the functional characterization of the VvGATA gene and study of its response to light and phytohormone. Results indicated that some VvGATA genes displayed differential responses to light and phytohormones, suggesting their role in light and hormone signaling pathways. A thorough analysis of GATA transcription factors in grape (V. vinifera L.) presented the characterization and functional prediction of VvGATA genes. The data presented here lay the foundation for further functional studies of grape GATA transcription factors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,437
Score d'incertitude au seuil0,473

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle