MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2887609307 · doi:10.1158/1538-7445.am2018-1117

Abstract 1117: Norrin signaling is protumorigenic in glioblastoma progression

2018· article· en· W2887609307 sur OpenAlexaff
Ahmed El‐Sehemy, Hayden Selvadurai, Katherine Rowland, Peter B. Dirks, Valerie A. Wallace

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésWnt signaling pathwayCancer researchBiologyCarcinogenesisSignal transductionTumor progressionGene knockdownCell cultureCell growthCell biologyCancerGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Norrin signaling is protumorigenic in GBM progression A-Introduction: Norrin, a secreted factor encoded by the Norrie Disease Protein gene (NDP), is an atypical WNT ligand that specifically binds the FZD4 receptor and activates the canonical WNT signaling pathway in endothelial cells to regulate vascular development and barrier function in the brain. Recently, our group identified a novel tumor inhibitory function of NDP/FZD4 signaling in the endothelium in mouse models of medulloblastoma. Here we investigated the function of the NDP/FZD4 signaling axis in glioblastoma (GBM) progression. B-Experimental approaches GBM patients' survival data was obtained from TCGA and analyzed using the cBioportal server. Low passage mitogen expanded GBM cancer stem cell lines were established from primary tumors using standard conditions. NDP expression in experimental cell lines was modulated using lentiviral delivery of short hairpins or full length cDNA. Cell number was assessed by trypan blue cell counting, and sphere forming cell frequency was tested using extreme limited dilution assay (ELDA). For in vivo assessment of tumorigenesis, experimental and control cell lines were xenografted intracranially in NOD/SCID/Gamma (NSG) mice and symptomatic animals were euthanized and brains collected for histological analysis. C-Results Analysis of GBM data from TCGA showed that survival and NDP expression are negatively GBM. Gene expression analysis indicated variable expression levels of NDP/FZD4 signaling pathway components in a panel of 10 primary GBM stem cell lines. In vitro gain and loss of function studies showed that NDP promotes proliferation and sphere formation in GBM. Moreover, the effects of are recapitulated in xenografts. NDP appears to control GBM differentiation, as it affects the proportion of cycling (Ki67+) cells and the level of stemness (Sox2 levels). Finally, NDP function is independent of FZD4 and canonical Wnt signaling, indicating that it functions through an alternative pathway. D-Conclusions Our in vitro and in vivo results indicate that Norrin might have an oncogeneic role in GBM. In addition, the effect of Norrin is FZD4- and WNT-independent. Our results indicate that targeting Norrin GBM might be a potential therapeutic approach. Citation Format: Ahmed A. Elsehemy, Hayden Selvadurai, Katherine Rowland, Peter Dirks, Valerie Wallace. Norrin signaling is protumorigenic in glioblastoma progression [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2018; 2018 Apr 14-18; Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2018;78(13 Suppl):Abstract nr 1117.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,407
Écart entre enseignants0,370 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCancer ResearchMême sujetCancer-related gene regulationTravaux en français237 207