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Enregistrement W2887654090 · doi:10.1158/1538-7445.am2018-4464

Abstract 4464: CPEB-2 is a tumor-suppressor gene in human breast cancer

2018· article· en· W2887654090 sur OpenAlexaff
Peeyush K. Lala, Joshua Tordjman, Mehdi Amiri, Asma Hasan, David A. Hess, Mousumi Majumder

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInflammatory mediators and NSAID effects
Établissements canadiensBrandon UniversityWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyCancer researchCancerHIF1ACancer cellAngiogenesisGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract We found that expression of cyclooxygenase (COX)-2 promotes breast cancer progression by multiple mechanisms, including stimulation of cancer cell proliferation, migration, invasiveness, epithelial-to-mesenchymal transition (EMT), angiogenesis, lymphangiogenesis and induction of stem-like cells (SLC). Through combined gene expression and microRNA microarray analyses of COX-2-transfected MCF-7 cells, we identified two oncogenic miRNAs, miR-526b and miR-655, up-regulated by COX-2. They collectively target 13 tumour suppressor-like genes down-regulated by COX-2, of which Cytoplasmic Polyadenylation Element-Binding Protein -2 (CPEB-2) was the single common target, whose function is unclear in breast cancer. CPEB-2 is known to downregulate mesenchymal transcription factor TWIST1 and translation of HIF1α. CPEB-2 has multiple isoforms (A-F), of which a high B: A isoform ratio was reported to confer anoikis-resistance, a metastatic phenotype, in breast cancer cells. We found that CPEB-2 expression was inversely correlated with COX-2 or the microRNAs miR-526b and miR-655 in breast cancer cell lines; it was very high in a non-tumorigenic mammary epithelial cell line MCF10A.To define its functional roles we knocked out CPEB-2 in MCF10A cells by CRISPR/Cas9-double nickase approach. CPEB-2-KO cells exhibited oncogenic phenotypes in vitro: increased proliferation, migration, invasion, EMT phenotype (decreased E-Cadherin, increased Vimentin, N-cadherin, SNAI1, and ZEB1) and SLC properties (increased spheroid formation and SLC-linked markers). P53 protein was found to be a novel translationally- regulated target of CPEB-2. CPEB-2KO cells, but not wild-type cells, produced lung colonies upon intravenous injection and orthotopic tumors (identified by HLA staining) upon implantation at mammary sites in NOD/SCID/IL2Rϒ-null mice. In human breast cancer tissues, compared to non-tumour breast tissues, isoform A/E of CPEB2 revealed a lower expression in HER2+ breast cancer samples, suggesting that CPEB-2A/E are the tumour-suppressor isoforms. These findings demonstrate that CPEB-2 is a tumour suppressor gene in breast cancer. (Supported by the OICR and the NSERC) Citation Format: Peeyush K. Lala, Joshua Tordjman, Mehdi Amiri, Asma Hasan, David Hess, Mousumi Majumder. CPEB-2 is a tumor-suppressor gene in human breast cancer [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2018; 2018 Apr 14-18; Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2018;78(13 Suppl):Abstract nr 4464.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,062
Tête enseignante GPT0,426
Écart entre enseignants0,365 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
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