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Enregistrement W2887941249 · doi:10.1101/388637

Focal cholesterol depletion during Fcγ receptor-mediated phagocytosis contributes to Lyn kinase regulation

2018· preprint· en· W2887941249 sur OpenAlexafffund
Stella M. Lu, Allen Volchuk, Gregory D. Fairn

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2018
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMonoclonal and Polyclonal Antibodies Research
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of TorontoSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchHospital for Sick ChildrenGovernment of Ontario
Mots-clésLYNPhagosomePhagocytosisCell biologyBiologyExocytosisKinaseLipid raftCholesterolSignal transductionTyrosine kinaseChemistryBiochemistrySecretion

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Cholesterol-rich nanodomains, historically referred to as lipid rafts, have previously been reported to be critical for proper Fcγ Receptor and Lyn kinase signaling during phagocytosis. Throughout the initial stages of phagocytosis, the nascent phagosome is actively remodeled by localized lipid metabolism and exocytosis. However, to date, little is known about the dynamics of cholesterol during this stage of particle engulfment. Using a genetically-encoded biosensor for cholesterol, we find that cholesterol is depleted from the nascent phagosome prior to sealing. Additionally, protein markers of both cholesterol-rich and cholesterol-poor nanodomains also clear from the site of phagocytosis arguing against the selective depletion of specific membrane domains. Consistent with previous studies we find that exocytosis contributes to the remodeling of the nascent phagosome. The displacement of cholesterol from the forming phagosome was paralleled by Lyn kinase helping to explain the reduction of phosphotyrosine signal in the nascent phagosome. This diminution of cholesterol and Lyn from the base of the cup may aid in the processivity of the phagocytic signal during pseudopod extension, and provide an unappreciated mechanism by which Lyn kinase signaling is regulated during phagocytosis. Summary Statement: Localized exocytosis dilutes cholesterol from the phagocytic cup leading to the displacement of Lyn kinase and an attenuation of signaling.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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