Abstract 3672: The three-dimensional (3D) spatial lamin A/C organization in normal lymphocytes, and in Hodgkin and Reed-Sternberg cells
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Classical Hodgkin Lymphoma (HL) is a B-Cell lymphoma comprising mononucleated Hodgkin cells (H) and diagnostic bi- to multi-nucleated Reed Sternberg cells (RS). Genomic instability in HL is characterized by telomere dysfunction caused by critically short telomeres and telomere uncapping. Super resolution microscopy showed significant increases in the amount of DNA-poor nuclear spaces in HL compared to normal primary lymphocytes. A direct 3D interaction between telomeres and shelterin protein TRF2 is progressively disrupted from H to RS cells by either massive upregulation or downregulation of TRF2. TRF2 interacts with nuclear matrix protein lamin A/C in the maintenance of the 3D genome organization, which is disturbed in H and RS cells. Therefore we hypothesized that the TRF2- telomere-lamin A/C interaction is also disturbed in H and RS cells and leads to organizational alterations of the genome in HL. To this end, we analyzed lamin A/C expression levels of lymphocytes, H and RS cells and found that lamin A/C is upregulated in cancer cells compared to both activated and resting lymphocytes. The regular homogeneous and round shaped pattern found in lymphocytes was replaced in H and RS cells by a more irregular one, characterized by the presence of lamin A/C invaginations and septa that subdivide the nuclei into multiple smaller compartments. Our data show no co-localization between telomeres and lamin A/C in the DNA-poor spaces. Lamin A/C bordered the DNA-poor spaces but was never found inside them or in association with inner telomere fragments. 3D TRF-2 staining showed upregulation of the protein compared to normal lymphocytes, in correlation with the observation made in EBV-negative patients with clinically aggressive disease. The analysis of pre-treatment Hodgkin's patients' samples will allow to determine whether the TRF2-telomere-lamin A/C binding is different in patients with recurrent versus non-recurrent disease. Citation Format: Fabio Contu, Aleksander Szczurek, Roberta Vanni, Hans Knecht, Sabine Mai. The three-dimensional (3D) spatial lamin A/C organization in normal lymphocytes, and in Hodgkin and Reed-Sternberg cells [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2018; 2018 Apr 14-18; Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2018;78(13 Suppl):Abstract nr 3672.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».