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Enregistrement W2887985782 · doi:10.1158/1538-7445.am2018-3672

Abstract 3672: The three-dimensional (3D) spatial lamin A/C organization in normal lymphocytes, and in Hodgkin and Reed-Sternberg cells

2018· article· en· W2887985782 sur OpenAlexaff
Fabio Contu, Aleksander Szczurek, Roberta Vanni, Hans Knecht, Sabine Mai

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNuclear Structure and Function
Établissements canadiensJewish General HospitalMontreal General HospitalUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTelomereLaminGenome instabilityDownregulation and upregulationShelterinBiologyCell biologyMolecular biologyDNA damageCancer researchDNAGeneticsGeneNucleusDNA-binding protein

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Classical Hodgkin Lymphoma (HL) is a B-Cell lymphoma comprising mononucleated Hodgkin cells (H) and diagnostic bi- to multi-nucleated Reed Sternberg cells (RS). Genomic instability in HL is characterized by telomere dysfunction caused by critically short telomeres and telomere uncapping. Super resolution microscopy showed significant increases in the amount of DNA-poor nuclear spaces in HL compared to normal primary lymphocytes. A direct 3D interaction between telomeres and shelterin protein TRF2 is progressively disrupted from H to RS cells by either massive upregulation or downregulation of TRF2. TRF2 interacts with nuclear matrix protein lamin A/C in the maintenance of the 3D genome organization, which is disturbed in H and RS cells. Therefore we hypothesized that the TRF2- telomere-lamin A/C interaction is also disturbed in H and RS cells and leads to organizational alterations of the genome in HL. To this end, we analyzed lamin A/C expression levels of lymphocytes, H and RS cells and found that lamin A/C is upregulated in cancer cells compared to both activated and resting lymphocytes. The regular homogeneous and round shaped pattern found in lymphocytes was replaced in H and RS cells by a more irregular one, characterized by the presence of lamin A/C invaginations and septa that subdivide the nuclei into multiple smaller compartments. Our data show no co-localization between telomeres and lamin A/C in the DNA-poor spaces. Lamin A/C bordered the DNA-poor spaces but was never found inside them or in association with inner telomere fragments. 3D TRF-2 staining showed upregulation of the protein compared to normal lymphocytes, in correlation with the observation made in EBV-negative patients with clinically aggressive disease. The analysis of pre-treatment Hodgkin's patients' samples will allow to determine whether the TRF2-telomere-lamin A/C binding is different in patients with recurrent versus non-recurrent disease. Citation Format: Fabio Contu, Aleksander Szczurek, Roberta Vanni, Hans Knecht, Sabine Mai. The three-dimensional (3D) spatial lamin A/C organization in normal lymphocytes, and in Hodgkin and Reed-Sternberg cells [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2018; 2018 Apr 14-18; Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2018;78(13 Suppl):Abstract nr 3672.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,559
Score d'incertitude au seuil0,723

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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