The maternal-to-zygotic transition in bovine in vitro-fertilized embryos is associated with marked changes in small non-coding RNAs†
Notice bibliographique
Résumé
In mammals, small non-coding RNAs (sncRNAs) have been reported to be important during early embryo development. However, a comprehensive assessment of the inventory of sncRNAs during the maternal-to-zygotic transition (MZT) has not been performed in an animal model that better represents the sncRNA biogenesis pathway in human oocytes and embryos. The objective of this study was to examine dynamic changes in expression of sncRNAs during the MZT in bovine embryos produced by in vitro fertilization (IVF), which occurs at the 8-cell stage. An unbiased, discovery-based approach was employed using small RNAseq to profile sncRNAs in bovine oocytes, 8-cell stage embryos and blastocyst stage embryos followed by network and ontology analyses to explore the functional relevance of differentially expressed micro-RNAS (miRNAs). The relative abundance of miRNAs was markedly higher in 8-cell stage embryos compared to oocytes or blastocyst stage embryos. This shift in miRNA population was largely associated with upregulation of miRNAs predicted to target genes involved in the biological processes of cell development, cell division, Wnt signaling, and pluripotency, among others. Distinct populations of piwi-interacting-like RNAs (pilRNAs) were identified in bovine oocytes and blastocyst stage embryos, though pilRNAs were nearly absent in 8-cell stage embryos. Also, small nucleolar RNAs were highly expressed in 8-cell stage embryos. Overall, these data reveal a strong dynamic shift in the relative abundance of sncRNAs associated with the MZT in bovine oocytes and embryos, suggesting that these molecules may play important roles in the shift from maternal to zygotic control of gene expression.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».