Identifying cirrhosis, decompensated cirrhosis and hepatocellular carcinoma in health administrative data: A validation study
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: To evaluate screening and treatment strategies, large-scale real-world data on liver disease-related outcomes are needed. We sought to validate health administrative data for identification of cirrhosis, decompensated cirrhosis and hepatocellular carcinoma among patients with known liver disease. METHODS: Primary patient data were abstracted from patients of the Toronto Center for Liver Disease with viral hepatitis (2006-2014), and all patients with liver disease from the Kingston Health Sciences Centre Hepatology Clinic (2013). We linked clinical information to health administrative data and tested a range of coding algorithms against the clinical reference standard. RESULTS: A total of 6,714 patients had primary chart data abstracted. A single physician visit code for cirrhosis was sensitive (98-99%), and a single hospital diagnostic code for cirrhosis was specific (91-96%). The most sensitive algorithm for decompensated cirrhosis was one cirrhosis code with any of: a hospital diagnostic code, death code, or procedure code for decompensation (range 88-99% across groups). The most specific was one cirrhosis code and one hospital diagnostic code (range 89-98% across groups). Two physician visit codes or a single hospital diagnostic code, death code, or procedure code combined with a code for cirrhosis were sensitive and specific for hepatocellular carcinoma (sensitivity 94-96%, specificity 93-98%). CONCLUSION: These sensitive and specific algorithms can be used to define patient cohorts or detect clinical outcomes using health administrative data. Our results will facilitate research into the adequacy of screening and treatment for patients with chronic viral hepatitis or other liver diseases.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,060 | 0,120 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».