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Enregistrement W2888364689 · doi:10.1371/journal.pone.0201120

Identifying cirrhosis, decompensated cirrhosis and hepatocellular carcinoma in health administrative data: A validation study

2018· article· en· W2888364689 sur OpenAlexafffundabout
Lauren Lapointe‐Shaw, Firass Georgie, David Carlone, Orlando Cerocchi, Hannah Chung, Yvonne DeWit, Jordan J. Feld, Laura Holder, Jeffrey C. Kwong, Beate Sander, Jennifer A. Flemming

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHepatitis C virus research
Établissements canadiensToronto Public HealthPublic Health OntarioUniversity of TorontoUniversity Health NetworkQueen's UniversityMcGill UniversityInstitute for Clinical Evaluative Sciences
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of TorontoOntario Ministry of Health and Long-Term CarePhysicians' Services Incorporated FoundationInstitute for Clinical Evaluative SciencesCancer Care Ontario
Mots-clésCirrhosisHepatocellular carcinomaMedicineInternal medicineGastroenterology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: To evaluate screening and treatment strategies, large-scale real-world data on liver disease-related outcomes are needed. We sought to validate health administrative data for identification of cirrhosis, decompensated cirrhosis and hepatocellular carcinoma among patients with known liver disease. METHODS: Primary patient data were abstracted from patients of the Toronto Center for Liver Disease with viral hepatitis (2006-2014), and all patients with liver disease from the Kingston Health Sciences Centre Hepatology Clinic (2013). We linked clinical information to health administrative data and tested a range of coding algorithms against the clinical reference standard. RESULTS: A total of 6,714 patients had primary chart data abstracted. A single physician visit code for cirrhosis was sensitive (98-99%), and a single hospital diagnostic code for cirrhosis was specific (91-96%). The most sensitive algorithm for decompensated cirrhosis was one cirrhosis code with any of: a hospital diagnostic code, death code, or procedure code for decompensation (range 88-99% across groups). The most specific was one cirrhosis code and one hospital diagnostic code (range 89-98% across groups). Two physician visit codes or a single hospital diagnostic code, death code, or procedure code combined with a code for cirrhosis were sensitive and specific for hepatocellular carcinoma (sensitivity 94-96%, specificity 93-98%). CONCLUSION: These sensitive and specific algorithms can be used to define patient cohorts or detect clinical outcomes using health administrative data. Our results will facilitate research into the adequacy of screening and treatment for patients with chronic viral hepatitis or other liver diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,033
Score d'incertitude au seuil0,737

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,402
Tête enseignante GPT0,422
Écart entre enseignants0,020 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations131
Publié2018
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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