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Enregistrement W2888375528 · doi:10.1210/jc.2018-00619

Glucose Is Involved in the Dynamic Regulation of m6A in Patients With Type 2 Diabetes

2018· article· en· W2888375528 sur OpenAlexaff
Ying Yang, Fan Shen, Wei Huang, Shanshan Qin, Jingtao Huang, Consolato Sergi, Bi‐Feng Yuan, Song‐Mei Liu

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Clinical Endocrinology & Metabolism · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensStollery Children's HospitalUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésDownregulation and upregulationMessenger RNAInternal medicineGene knockdownEndocrinologyDiabetes mellitusHypoglycemiaGene expressionType 2 diabetesChemistryMedicineGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Context: N6-methyladenosine (m6A) in mRNA is the most abundant and reversible modification. However, the mechanism behind the decrease in m6A in patients with type 2 diabetes (T2D) has not yet been thoroughly investigated. Objective: To clarify whether glucose is involved in the dynamic regulation of m6A in T2D and to identify a possible underlying mechanism. Methods: Liquid chromatography/electrospray ionization/tandem mass spectrometry and quantitative PCR were performed to determine the m6A content and the mRNA expression of target genes in 102 patients with T2D and 107 controls. An additional 12 patients with normal fasting blood glucose, emergency hyperglycemia, or emergency hypoglycemia, as well as HepG2 cells with high-glucose treatment and FTO knockout or overexpression were used to confirm the initial observations in patients. Results: In patients with T2D, the m6A content was decreased, and mRNA expression levels of FTO, METTL3, METTL14, and WTAP were increased. Interestingly, the m6A content was negatively associated with mRNA expression levels of METTL3, METTL14, and FTO. Moreover, FTO was positively correlated with serum glucose. In HepG2 cells, high glucose upregulated FTO protein, whereas it had no significant effect on METTL3 or METTL14. Additionally, mRNA expression levels of FOXO1, G6PC, and DGAT2 were significantly increased and positively correlated with FTO and serum glucose in patients. Conclusions: Our data revealed that in patients with T2D, high-glucose-enhanced FTO mRNA expression resulted in a decrease in m6A. The lower m6A content might be responsible for the upregulation of methyltransferases. Additionally, FTO induced mRNA expression of FOXO1, G6PC, and DGAT2 and was closely associated with glucose metabolism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,321
Écart entre enseignants0,302 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations275
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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