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Enregistrement W2888442326 · doi:10.1002/etc.4260

Prioritization of 10 organic flame retardants using an avian hepatocyte toxicogenomic assay

2018· article· en· W2888442326 sur OpenAlexaffabout
Florence Pagé‐Larivière, Suzanne Chiu, Stephanie P. Jones, Amani Farhat, Doug Crump, Jason M. O’Brien

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Toxicology and Chemistry · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueToxic Organic Pollutants Impact
Établissements canadiensEnvironment and Climate Change Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésToxicogenomicsToxicityCormorantTranscriptomeEnvironmental toxicologyChemistryIn vitro toxicologyIn vitroEnvironmental chemistryBiologyBiochemistryGeneEcologyGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

As the number of chemicals developed and used by industry increases, the inherent limitations of traditional toxicology approaches become an unavoidable issue. To help meet the demand for toxicity evaluation, new methods, such as high-throughput toxicity screening, are currently being developed to permit rapid determination of toxic, molecular, and/or biochemical effects of a wide range of chemicals. In the present study, we demonstrate the utility of an avian in vitro toxicogenomics screening approach to determine the cytotoxic and transcriptomic effects of 10 organic flame retardants (OFRs) currently of international priority for ecological risk evaluation to prioritize and inform future toxicological studies. Hepatocytes from 2 avian species, chicken and double-crested cormorant, were prepared and exposed for 24 h to various concentrations (0-300 μM) of the following 10 OFRs: Chemical Abstracts Service registration numbers 29761-21-5, 56803-37-3 (p-tert-butylphenyl diphenyl phosphate [BPDP]), 65652-41-7, 68937-41-7 (phenol, isopropylated, phosphate [3:1] [IPPP]), 95906-11-9, 19186-97-1, 26040-51-7, 35948-25-5, 21850-44-2, and 25713-60-4. Cell viability, the 7-ethoxyresorufin-O-deethylase assay, and transcriptomic analysis using species-specific ToxChip polymerase chain reaction arrays were performed to evaluate the in vitro effect of these OFRs. Of the 10 OFRs assessed, BPDP and IPPP elicited the strongest cytotoxic and transcriptomic responses in both chicken and double-crested cormorant hepatocytes and are therefore recommended as priority candidates for further wildlife toxicological investigations. Environ Toxicol Chem 2018;37:3134-3144. © 2018 Crown in the right of Canada. Published by Wiley Periodicals Inc. on behalf of SETAC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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