DETECTION OF LYMPHOPROLIFERATIVE DISEASE VIRUS IN CANADA IN A SURVEY FOR VIRUSES IN ONTARIO WILD TURKEYS (MELEAGRIS GALLOPAVO)
Notice bibliographique
Résumé
The successful reintroduction of Wild Turkeys ( Meleagris gallopavo) to Ontario, Canada, has led to established populations in southern portions of the province and currently allows for biannual hunting seasons. These populations geographically overlap Domestic Turkey farms, an important sector of the provincial agri-food industry. Potential pathogen transmission between Wild Turkeys and Domestic Turkeys ( Meleagris gallopavo) is a concern, because they are susceptible to infection with many of the same pathogens and have direct and indirect contact in outdoor or open farm settings and contaminated environmental substrates. However, data concerning potential poultry pathogens in Wild Turkeys in Canada are scarce. Thus, we assessed the prevalence and geographic distribution of geographically relevant viruses in Ontario Wild Turkeys. Oropharyngeal and cloacal swabs were tested for avian influenza viruses (AIV) by real-time reverse transcriptase (RT)-PCR ( n=207), pooled tissues for lymphoproliferative disease virus (LPDV; n=183) and reticuloendotheliosis virus ( n=119) by PCR, and gross skin lesions by real-time RT-PCR for avian poxvirus ( n=8). We sequenced a fragment of the gag polyprotein (p31) gene of LPDV on a subset ( n=10) of LPDV-positive samples for phylogenetic analysis and tested additional upland game bird species ( n=39) and domestic fowl for LPDV ( n=17). To the best of our knowledge, we document the first detection of LPDV in Wild Turkeys in Canada, with a prevalence of 65% (119/183). Phylogenetic analysis revealed that LPDV sequences from Ontario were genetically similar to other North American strains and did not group into separate clades. Reticuloendotheliosis virus was detected in 4% (5/119) of LPDV-positive Wild Turkeys. Grossly evident skin lesions from five Wild Turkeys tested positive for poxvirus, and all turkeys tested negative for AIV. This study provides evidence of LPDV circulation in Canada and provides a baseline for comparison with future Wild Turkey pathogen surveillance and monitoring in Ontario and elsewhere.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».