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Enregistrement W2888625895 · doi:10.7589/2018-01-013

DETECTION OF LYMPHOPROLIFERATIVE DISEASE VIRUS IN CANADA IN A SURVEY FOR VIRUSES IN ONTARIO WILD TURKEYS (MELEAGRIS GALLOPAVO)

2018· article· en· W2888625895 sur OpenAlexaffabout
Amanda M. MacDonald, Claire M. Jardine, Jeff Bowman, Leonardo Susta, Nicole M. Nemeth

Notice bibliographique

RevueJournal of Wildlife Diseases · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHerpesvirus Infections and Treatments
Établissements canadiensMinistry of Natural Resources and ForestryTrent UniversityUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMeleagris gallopavoBiologyPoultry farmingVeterinary medicineVirusVirologyPhylogenetic treeInfectious bronchitis virusReticuloendotheliosis virusTransmission (telecommunications)ZoologyGeneEcologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The successful reintroduction of Wild Turkeys ( Meleagris gallopavo) to Ontario, Canada, has led to established populations in southern portions of the province and currently allows for biannual hunting seasons. These populations geographically overlap Domestic Turkey farms, an important sector of the provincial agri-food industry. Potential pathogen transmission between Wild Turkeys and Domestic Turkeys ( Meleagris gallopavo) is a concern, because they are susceptible to infection with many of the same pathogens and have direct and indirect contact in outdoor or open farm settings and contaminated environmental substrates. However, data concerning potential poultry pathogens in Wild Turkeys in Canada are scarce. Thus, we assessed the prevalence and geographic distribution of geographically relevant viruses in Ontario Wild Turkeys. Oropharyngeal and cloacal swabs were tested for avian influenza viruses (AIV) by real-time reverse transcriptase (RT)-PCR ( n=207), pooled tissues for lymphoproliferative disease virus (LPDV; n=183) and reticuloendotheliosis virus ( n=119) by PCR, and gross skin lesions by real-time RT-PCR for avian poxvirus ( n=8). We sequenced a fragment of the gag polyprotein (p31) gene of LPDV on a subset ( n=10) of LPDV-positive samples for phylogenetic analysis and tested additional upland game bird species ( n=39) and domestic fowl for LPDV ( n=17). To the best of our knowledge, we document the first detection of LPDV in Wild Turkeys in Canada, with a prevalence of 65% (119/183). Phylogenetic analysis revealed that LPDV sequences from Ontario were genetically similar to other North American strains and did not group into separate clades. Reticuloendotheliosis virus was detected in 4% (5/119) of LPDV-positive Wild Turkeys. Grossly evident skin lesions from five Wild Turkeys tested positive for poxvirus, and all turkeys tested negative for AIV. This study provides evidence of LPDV circulation in Canada and provides a baseline for comparison with future Wild Turkey pathogen surveillance and monitoring in Ontario and elsewhere.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,031
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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