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Enregistrement W2888834459 · doi:10.3389/fnmol.2018.00286

Characterization of the Zebrafish Glycine Receptor Family Reveals Insights Into Glycine Receptor Structure Function and Stoichiometry

2018· article· en· W2888834459 sur OpenAlexfundno aff
Sean E. Low, Daishi Ito, Hiromi Hirata

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Molecular Neuroscience · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueReceptor Mechanisms and Signaling
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesEpilepsiatutkimussäätiöJapan Epilepsy Research FoundationJapan Society for the Promotion of ScienceUniversity of the Sunshine CoastMinistry of Education, Culture, Sports, Science and TechnologyInstitute of GeneticsNaito Foundation
Mots-clésGlycine receptorPicrotoxinHomomericZebrafishBiologyProtein subunitReceptorGlycineTransmembrane domainXenopusStrychnineTransmembrane proteinCell biologyGephyrinCys-loop receptorsBiochemistryGABAA receptorAmino acidGeneAcetylcholine receptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To study characterization of zebrafish glycine receptors (zGlyRs), we assessed expression and function of five α- and two ß-subunit encoding GlyR in zebrafish. Our qPCR analysis revealed variable expression during development, while in situ hybridizations uncovered expression in the hindbrain and spinal cord; a finding consistent with the reported expression of GlyR subunits in these tissues from other organisms. Electrophysiological recordings using Xenopus oocytes revealed that all five α subunits form homomeric receptors activated by glycine, and inhibited by strychnine and picrotoxin. In contrast, ß subunits only formed functional heteromeric receptors when co-expressed with α subunits. Curiously, the second transmembranes of both ß subunits were found to lack a phenylalanine at the sixth position that is commonly associated with conferring picrotoxin resistance to heteromeric receptors. Consistent with the absence of phenylalanines at the sixth position, heteromeric zGlyRs often lacked significant picrotoxin resistance. Subsequent efforts revealed that resistance to picrotoxin in both zebrafish and human heteromeric GlyRs involves known residues within transmembrane 2, as well as previously unknown residues within transmembrane 3. We also found that a dominant mutation in human GlyRα1 that gives rise to hyperekplexia, and recessive mutations in zebrafish GlyRßb that underlie the bandoneon family of motor mutants, result in reduced receptor function. Lastly, through the use of a concatenated construct we demonstrate that zebrafish heteromeric receptors assemble with a stoichiometry of 3α:2ß. Collectively, our findings have furthered our knowledge regarding the assembly of heteromeric receptors, and the molecular basis of ß subunit-conferred picrotoxin resistance. These results should aid in future investigations of glycinergic signaling in zebrafish and mammals.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,104
Score d'incertitude au seuil0,619

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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