High-Frequency Occurrence of Surfactin Monomethyl Isoforms in the Ferment Broth of a Bacillus subtilis Strain Revealed by Ion Trap Mass Spectrometry
Notice bibliographique
Résumé
Surfactins are cyclic lipopeptides consisting of a β-hydroxy fatty acid of various chain length and a peptide ring of seven amino acids linked together by a lactone bridge, forming the cyclic structure of the peptide chain. These compounds are produced mainly by Bacillus species and possess numerous biological effects such as antimicrobial (antiviral, antibacterial, and antifungal) activities. A mixture of surfactins extracted from Bacillus subtilis strain SZMC 6179J was examined by HPLC-ESI-IT-MS technique, enhancing their separation to reveal novel lipopeptide varieties with higher masses and to characterize their structures. During the MS2 spectra analyses of their sodiated molecular ions [M + Na]+, a previously rarely encountered group of surfactins was detected and two novel types of the group were discovered containing methyl esterified aspartic acid residue in their fifth amino acid position. The relative amounts of these monomethyl isoforms exceeded 35% of the produced surfactin in total. In the m/z value of 1114, all the detected isoforms possessed aspartic acid 4-methyl ester residue in their fifth amino acid position (C17-[Lxx4, AME5], C18-[AME5]), offering an opportunity to separate a pure fraction of the compound and to study its biological activities in the future.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».