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Enregistrement W2888878191 · doi:10.3389/fonc.2018.00348

The Pan-Cytokeratin Staining Intensity and Fractal Computational Analysis of Breast Tumor Malignant Growth Patterns Prognosticate the Occurrence of Distant Metastasis

2018· article· en· W2888878191 sur OpenAlexaff
Nemanja Rajković, Xingyu Li, Konstantinos N. Plataniotis, Ksenija Kanjer, Marko Radulović, Nebojša T. Milošević

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Oncology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueAI in cancer detection
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesMinistarstvo Prosvete, Nauke i Tehnološkog Razvoja
Mots-clésCytokeratinMetastasisMedicineStainingFractalPathologyOncologyFractal analysisBreast tumorFractal dimensionIntensity (physics)ImmunohistochemistryInternal medicineBreast cancerCancer researchCancerMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Improved prognosis of breast cancer outcome could prolong patient survival by reliable identification of patients at high risk of metastasis occurrence to benefit from more aggressive treatments. Based on such clinical need, we prognostically evaluated the malignant cells in breast tumors as the obvious potential source of unexploited prognostic information. The patient group was homogeneous, without any systemic treatments or lymph node spread, with smaller tumor size (pT1/2) and a long follow-up. Epithelial cells were labeled with AE1/AE3 pan-cytokeratin antibody cocktail and comprehensively analyzed. Monofractal and multifractal analysis was applied for quantification of distribution, shape and texture of malignant cell clusters, while mean pixel intensity and total area were measures of the pan-cytokeratin immunostaining intensity. The results surprisingly indicate that simple binary images and monofractal analysis provided better prognostic information then greyscale images and multifractal analysis. The key findings were that shapes and distribution of malignant cell clusters (by binary fractal dimension; AUC=0.29), their contour shapes (by outline fractal dimension; AUC=0.31) and intensity of the pan-cytokeratin immunostaining (by mean pixel intensity; AUC=0.30) offered significant performance in metastasis risk prognostication. These results reveal a surprising association of the lower pan-cytokeratin staining intensity with the high metastasis risk. Another interesting result was that multivariate analysis could confirm the prognostic independence only for fractal and not for intensity features. The obtained results reveal several novel and unexpected findings highlighting the independent prognostic efficacy of malignant cell cluster distribution and contour shapes in breast tumors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,638
Score d'incertitude au seuil0,282

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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