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Enregistrement W2888964990 · doi:10.1080/03014223.2018.1510843

Study of COI sequences from endemic New Zealand aphids highlights high mitochondrial DNA diversity in Rhopalosiphina (Hemiptera: Aphididae)

2018· article· en· W2888964990 sur OpenAlexaff
Colleen Podmore, Ian D. Hogg, G.M. Drayton, B.I.P. Barratt, Ian Scott, Robert G. Foottit, D.A.J. Teulon, Simon Bulman

Notice bibliographique

RevueNew Zealand Journal of Zoology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueInsect-Plant Interactions and Control
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyAphididaeAphidEndemismHemipteraEcologyPopulationLineage (genetic)Mitochondrial DNASpecies complexHost (biology)BotanyZoologyHomopteraPEST analysisPhylogenetic treeGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Focussed searches were made across New Zealand between 2013 and 2016, for endemic aphids from the Schizaphis (Rhopalosiphina) genus, which is currently represented by two putative, undescribed species from the endemic host plants Aciphylla and Dracophyllum . Cytochrome c oxidase I (COI) gene sequences (48 in total) from the Schizaphis were analysed together with those from a broader collection of New Zealand endemic aphids that has been assembled since the year 2000. The bulk of the Schizaphis belonged to two clusters corresponding to the host plant genera. Two aphids from central North Island Dracophyllum represented a much diverged lineage without clear affiliations to other New Zealand Schizaphis . Inter‐population variation in the New Zealand Schizaphis was high compared with that seen in international studies of Aphidinae and among populations of other endemic New Zealand Aphidina. Within Schizaphis from Dracophyllum , geography played an apparent role in genetic structuring, with populations from Taranaki (North Island) and especially Mt Lyford (South Island) being divergent from those on the South Island main divide. Two distinct lineages of Schizaphis , which co‐occurred at some sites, were found on Aciphylla . Our sequence comparisons, including GMYC analyses, indicated up to five New Zealand Schizaphis lineages, and two newly discovered endemic Aphis species from the host plants Clematis and Hebe .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,206
Score d'incertitude au seuil0,972

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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