Allelic variation of vernalization and photoperiod response genes in a diverse set of North American high latitude winter wheat genotypes
Notice bibliographique
Résumé
The major physiological determinants of wheat (Triticum aestivum L.) phenology in a given area are a response to vernalization temperature and day length, which are at least in part, regulated by the allelic variation at the vernalization (VRN) and photoperiod (PPD) loci, respectively. Characterization of the existing genetic variation for plant phenology in winter wheat can assist breeding programs improve adaptation to local environments and to optimize wheat phenology for the changing climate. The objectives of this research were to characterize the allelic variation at the major VRN and PPD loci in a diverse panel of high latitude winter wheat genotypes (n = 203) and to associate the allelic variation with phenologic, agronomic and adaptation traits. The panel was genotyped using allele-specific markers at vernalization (VRN-A1, VRN-B1, VRN-D1 and VRN-B3) and photoperiod (PPD-A1, PPD-B1, and PPD-D1) loci and phenotyped for agronomically-important traits. Though photoperiod sensitivity was more prevalent, most of the variation in the phenology of the winter wheat panel was explained by allelic variation at PPD-D1, PPD-A1, and the interaction between these loci. While a typical high latitude winter wheat genotype is one that carries winter alleles at all major VRN loci and photoperiod sensitive alleles at the major PPD loci, in lower latitudes where winters are milder, the presence of one or two photoperiod insensitive alleles seems to contribute to higher yield and wider adaptation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».