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Enregistrement W2889311142 · doi:10.1371/journal.pone.0202674

Controlled feature selection and compressive big data analytics: Applications to biomedical and health studies

2018· article· en· W2889311142 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueStatistical Methods and Inference
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Nursing ResearchNational Institute on AgingNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchMichigan Institute for Data Science, University of MichiganUniversity of California, San DiegoGenentechNational Institutes of HealthNational Institute of Neurological Disorders and StrokeIXICOServierEisaiNorthern California Institute for Research and EducationPfizerBiogenBioClinicaAlzheimer's AssociationAmorfix Life SciencesBayer HealthCareAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeMeso Scale DiagnosticsF. Hoffmann-La RocheNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesSynarcUniversity of Southern CaliforniaMedpaceBristol-Myers SquibbEli Lilly and CompanyAstraZenecaNovartis Pharmaceuticals CorporationFoundation for the National Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésComputer scienceBig dataFeature selectionInferenceBootstrapping (finance)Data miningScalabilityStatistical inferenceMachine learningArtificial intelligenceMathematicsStatistics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The theoretical foundations of Big Data Science are not fully developed, yet. This study proposes a new scalable framework for Big Data representation, high-throughput analytics (variable selection and noise reduction), and model-free inference. Specifically, we explore the core principles of distribution-free and model-agnostic methods for scientific inference based on Big Data sets. Compressive Big Data analytics (CBDA) iteratively generates random (sub)samples from a big and complex dataset. This subsampling with replacement is conducted on the feature and case levels and results in samples that are not necessarily consistent or congruent across iterations. The approach relies on an ensemble predictor where established model-based or model-free inference techniques are iteratively applied to preprocessed and harmonized samples. Repeating the subsampling and prediction steps many times, yields derived likelihoods, probabilities, or parameter estimates, which can be used to assess the algorithm reliability and accuracy of findings via bootstrapping methods, or to extract important features via controlled variable selection. CBDA provides a scalable algorithm for addressing some of the challenges associated with handling complex, incongruent, incomplete and multi-source data and analytics challenges. Albeit not fully developed yet, a CBDA mathematical framework will enable the study of the ergodic properties and the asymptotics of the specific statistical inference approaches via CBDA. We implemented the high-throughput CBDA method using pure R as well as via the graphical pipeline environment. To validate the technique, we used several simulated datasets as well as a real neuroimaging-genetics of Alzheimer's disease case-study. The CBDA approach may be customized to provide generic representation of complex multimodal datasets and to provide stable scientific inference for large, incomplete, and multisource datasets.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,393
Score d'incertitude au seuil0,249

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,495
Tête enseignante GPT0,468
Écart entre enseignants0,027 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle