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Enregistrement W2889411851 · doi:10.1242/jcs.216226

Rab4A organizes endosomal domains for sorting cargo to lysosome-related organelles

2018· article· en· W2889411851 sur OpenAlexfundno aff
Sudeshna Nag, Shikha Rani, Sarmistha Mahanty, Christin Bissig, P. D. Arora, Cristina Azevedo, Adolfo Saiardi, Peter van der Sluijs, Cédric Delevoye, Guillaume van Niel, Graça Raposo, Subba Rao Gangi Setty

Notice bibliographique

RevueJournal of Cell Science · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilThe Wellcome Trust DBT India AllianceMedical Research Council CanadaLabexFondation ARC pour la Recherche sur le CancerIndo-French Centre for the Promotion of Advanced ResearchAgence Nationale de la RechercheWellcome Trust
Mots-clésBiologyLysosomeEndosomeSortingCell biologyOrganelleBiochemistryComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Sorting endosomes (SEs) are the regulatory hubs for sorting cargo to multiple organelles, including lysosome-related organelles, such as melanosomes in melanocytes. In parallel, melanosome biogenesis is initiated from SEs with the processing and sequential transport of melanocyte-specific proteins toward maturing melanosomes. However, the mechanism of cargo segregation on SEs is largely unknown. Here, RNAi screening in melanocytes revealed that knockdown of Rab4A results in defective melanosome maturation. Rab4A-depletion increases the number of vacuolar endosomes and disturbs the cargo sorting, which in turn lead to the mislocalization of melanosomal proteins to lysosomes, cell surface and exosomes. Rab4A localizes to the SEs and forms an endosomal complex with the adaptor AP-3, the effector rabenosyn-5 and the motor KIF3, which possibly coordinates cargo segregation on SEs. Consistent with this, inactivation of rabenosyn-5, KIF3A or KIF3B phenocopied the defects observed in Rab4A-knockdown melanocytes. Further, rabenosyn-5 was found to associate with rabaptin-5 or Rabip4/4′ (isoforms encoded by Rufy1) and differentially regulate cargo sorting from SEs. Thus, Rab4A acts a key regulator of cargo segregation on SEs. This article has an associated First Person interview with the first author of the paper.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,311

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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