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Enregistrement W2889414245 · doi:10.1021/acs.jpcb.8b06557

Can Arginine Inhibit Insulin Aggregation? A Combined Protein Crystallography, Capillary Electrophoresis, and Molecular Simulation Study

2018· article· en· W2889414245 sur OpenAlexfundno aff
Kryštof Březina, Élise Duboué-Dijon, Vladimír Palivec, Jiřı́ Jiráček, Tomáš Křížek, Cristina Viola, Tim Ganderton, A.M. Brzozowski, Pavel Jungwirth

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry B · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Structure and Dynamics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesFP7 People: Marie-Curie ActionsEuropean Regional Development FundMedical Research CouncilMedical Research Council CanadaAkademie Věd České RepublikyEuropean Molecular Biology Organization
Mots-clésArginineInsulinIonic strengthCapillary electrophoresisIn vivoChemistryBiophysicsElectrophoresisMolecular dynamicsIonic bondingChromatographyBiochemistryCrystallographyAmino acidBiologyIonEndocrinologyAqueous solutionPhysical chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The oligomeric state of the storage form of human insulin in the pancreas, which may be affected by several endogenous components of β-cell storage granules such as arginine, is not known. Here, the effect of arginine on insulin oligomerization is investigated independently by protein crystallography, molecular dynamics simulations, and capillary electrophoresis. The combined results point to a strong effect of ionic strength on insulin assembly. Molecular simulations and electrophoretic measurements at low/mM salt concentrations show no significant effect of arginine on insulin aggregation. In contrast, crystallographic data at high/molar ionic strength indicate inhibition of insulin hexamerization by arginine due to its binding at the site relevant for intermolecular contacts, which was also observed in MD simulations. Our results thus bracket the in vivo situation in pancreatic β-cell storage granules, where the ionic strength is estimated to be in the hundreds of millimolar to submolar range. The present findings add to a molecular understanding of in vivo insulin oligomerization and storage, with additional implications for insulin stability in arginine-rich injections.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,451

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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