MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2889659853 · doi:10.1101/414920

Rates of increase of antibiotic resistance and ambient temperature in Europe: a cross-national analysis of 28 countries between 2000-2016

2018· preprint· en· W2889659853 sur OpenAlexafffundabout
Sarah F. McGough, Derek R. MacFadden, Mohammad W. Hattab, Kåre Mølbak, Mauricio Santillana

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2018
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAntibiotic Use and Resistance
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésAntibiotic resistanceAntibioticsResistance (ecology)PopulationConsumption (sociology)BiologyDemographyEnvironmental healthMedicineEcologyMicrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Widely recognized as a major public health threat globally, the rapid increase of antibiotic resistance in bacteria could soon render our most effective method to combat infections obsolete. Factors influencing the burden of resistance in human populations remain poorly described, though temperature is known to play an important role in mechanisms at the bacterial level. Methods We performed an ecologic analysis of country level antibiotic resistance prevalence in 3 common bacterial pathogens across 28 countries in Europe, and used multivariable models to evaluate associations with minimum temperature and other predictors over a 17-year period (2000-2016). We quantified the effects of minimum temperature, population density, and antibiotic consumption on the rate of change of antibiotic resistance across geographies. Findings For three common bacterial pathogens and four classes of antibiotics, we found evidence of a long-term effect of ambient minimum temperature on rates of increase of antibiotic resistance across 28 countries in Europe between 2000-2016. Specifically, we show that across all antibiotic classes for the pathogens E. coli and K. pneumoniae , European countries with 10°C warmer ambient temperatures have experienced more rapid increases in antibiotic resistance over the 17-year period, ranging between 0.33%/year (95% CI 0.2, 0.5) and 1.2%/year (0.4, 1.9), even after accounting for recognized drivers of resistance including antibiotic consumption and population density. We found a decreasing relationship for S. aureus and methicillin of −0.4%/year (95% CI −0.7, 0.0), reflecting widespread declines in MRSA across Europe over the study period. Interpretation Ambient temperature may be an important modulator of the rate of change of antibiotic resistance. Our findings suggest that rising temperatures globally may hasten the spread of resistance and complicate efforts to mitigate it. Funding Canadian Institutes of Health Research Fellowship (D.R.M.).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,019

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2018
Routes d'admission3
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)Même sujetAntibiotic Use and ResistanceTravaux en français237 207