MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2889835507 · doi:10.5740/jaoacint.18-0227

Validation of a Modified ANSR® for E. coli O157:H7 Method for Detection of E. coli O157:H7 in Select Foods

2018· article· en· W2889835507 sur OpenAlexaff
Susan Alles, Brooke Roman, Quynh-Nhi Le, Edan Hosking, Wesley Colangelo, Eric Tovar, Preetha Biswas, Mark Mozola, Robert Donofrio, Y. Chen, Michael H. Brodsky, Joseph Odumeru

Notice bibliographique

RevueJournal of AOAC International · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueAdvanced Chemical Sensor Technologies
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEscherichia coliChromatographyMicrobiologyFood scienceChemistryComputational biologyComputer scienceBiologyGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background: The ANSR method is based on isothermal nucleic acid amplification technology. The modifications to assay components improve sensitivity of the assay and robustness of the internal positive control. Objective: A Performance Tested MethodSM validation study was conducted to assess performance of a modified version of the ANSR® for Escherichia coli O157:H7 method. Methods: The validation study included inclusivity/exclusivity, matrix, robustness, accelerated stability, and independent laboratory testing. Results: In inclusivity testing of 55 strains of E. coli O157:H7 and E. coli O157:NM variants, all strains produced positive results. In exclusivity testing of 41 strains including E. coli of other serotypes and bacteria of closely related genera, all strains produced negative results. In matrix testing of beef trim, raw ground beef, spinach, and sprout-irrigation water, ANSR method performance was compared with that of the U.S. Department of Agriculture Food Safety and Inspection Service Microbiology Laboratory Guidebook or the U.S. Food and Drug Administration Bacteriological Analytical Manual reference culture procedures. Conclusions: all trials, ANSR method performance was not statistically different from that of the reference methods. Results of independent laboratory testing of ground beef corroborated those of internal testing. Introducing modest changes to three assay operating parameters did not materially affect ANSR method performance. Finally, accelerated stability testing results of three independently manufactured lots of ANSR reagents support a shelf-life of 1 year when stored at 2–8°C.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,349
Score d'incertitude au seuil0,457

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of AOAC InternationalMême sujetAdvanced Chemical Sensor TechnologiesTravaux en français237 207