Activity-Based Protein Profiling of Intraoperative Serine Hydrolase Activities during Cardiac Surgery
Notice bibliographique
Résumé
The processes involved in the initiation of acute kidney injury (AKI) following cardiopulmonary bypass (CPB) are thought to occur during the intraoperative period. Such a rapid development might indicate that some of the inductive events are not dependent on de novo protein synthesis, raising the possibility that changes in activities of pre-existing enzymes could contribute to the development of AKI. Activity-based protein profiling (ABPP) was used to compare the serine hydrolase enzyme activities present in the urines of CPB patients who subsequently developed AKI versus those who did not (non-AKI) during the intra- and immediate postoperative periods. Sequential urines collected from a nested case-control cohort of AKI and non-AKI patients were reacted with a serine hydrolase activity probe, fluorophosphonate-TAMRA, and separated by SDS-PAGE. The patterns and levels of probe-labeled proteins in the two groups were initially comparable. However, within 1 h of CPB there were significant pattern changes in the AKI group. Affinity purification and mass spectrometry-based analysis of probe-labeled enzymes in AKI urines at 1 h CPB and arrival to the intensive care unit (ICU) identified 28 enzymes. Quantitative analysis of the activity of one of the identified enzymes, kallikrein-1, revealed some trends suggesting differences in the levels and temporal patterns of enzyme activity between a subset of patients who developed AKI and those who did not. A comparative analysis of affinity-purified probe reacted urinary proteins from these patient groups during the intraoperative period suggested the presence of both shared and unique enzyme patterns. These results indicate that there are intraoperative changes in the levels and types of serine hydrolase activities in patients who subsequently develop AKI. However, the role of these activity differences in the development of AKI remains to be determined.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».