The Histone Demethylase LSD1 Regulates B Cell Proliferation and Plasmablast Differentiation
Notice bibliographique
Résumé
B cells undergo epigenetic remodeling as they differentiate into Ab-secreting cells (ASC). LSD1 is a histone demethylase known to decommission active enhancers and cooperate with the ASC master regulatory transcription factor Blimp-1. The contribution of LSD1 to ASC formation is poorly understood. In this study, we show that LSD1 is necessary for proliferation and differentiation of mouse naive B cells (nB) into plasmablasts (PB). Following LPS inoculation, LSD1-deficient hosts exhibited a 2-fold reduction of splenic PB and serum IgM. LSD1-deficient PB exhibited derepression and superinduction of genes involved in immune system processes; a subset of these being direct Blimp-1 target-repressed genes. Cell cycle genes were globally downregulated without LSD1, which corresponded to a decrease in the proliferative capacity of LSD1-deficient activated B cells. PB lacking LSD1 displayed increased histone H3 lysine 4 monomethylation and chromatin accessibility at nB active enhancers and the binding sites of transcription factors Blimp-1, PU.1, and IRF4 that mapped to LSD1-repressed genes. Together, these data show that LSD1 is required for normal in vivo PB formation, distinguish LSD1 as a transcriptional rheostat and epigenetic modifier of B cell differentiation, and identify LSD1 as a factor responsible for decommissioning nB active enhancers.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».