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Enregistrement W2889907857 · doi:10.3389/fmicb.2018.02130

Deficiency of MecA in Streptococcus mutans Causes Major Defects in Cell Envelope Biogenesis, Cell Division, and Biofilm Formation

2018· article· en· W2889907857 sur OpenAlexfundno aff
Arpan De, Ashton N. Jorgensen, Wandy L. Beatty, José A. Lemos, Zezhang T. Wen

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Microbiology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueStreptococcal Infections and Treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Dental and Craniofacial ResearchDalhousie University
Mots-clésBiofilmCell envelopeMutantStreptococcus mutansCell divisionBiologyCell biologyBiogenesisMicrobiologyBacterial adhesinCell growthWestern blotCellBiochemistryEscherichia coliBacteriaGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

MecA is an adaptor protein that guides the ClpC/P-mediated proteolysis. A S. mutans MecA-deficient mutant was constructed by double-crossover allelic exchange and analyzed for the effects of such a deficiency on cell biology and biofilm formation. Unlike the wild-type, UA159, the mecA mutant, TW416, formed mucoid and smooth colonies, severely clumped in broth and had a reduced growth rate. Transmission electron microscopy analysis revealed that TW416 grows primarily in chains of giant “swollen” cells with multiple asymmetric septa, unlike the coccoid form of UA159. As compared to UA159, biofilm formation by TW416 was significantly reduced regardless of the carbohydrate sources used for growth (P<0.001). Western blot analysis of TW416 whole cell lysates showed a reduced expression of the glucosyltransferase GtfC and GtfB, as well as the P1 and WapA adhesins providing an explanation for the defective biofilm formation of TW416. When analyzed by a colorimetric assay, the cell wall phosphate of the mutant murein sacculi was almost 20-fold lower than the parent strain (P<0.001). Interestingly, however, when analyzed using immunoblotting of the murein sacculi preps with UA159 whole cell antiserum as a probe, TW416 was shown to possess significantly higher signal intensity as compared to the wild-type. There is also evidence that MecA in S. mutans is more than an adapter protein, although how it modulates the bacterial pathophysiology, including cell envelope biogenesis, cell division, and biofilm formation awaits further investigation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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