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Enregistrement W2889929200 · doi:10.1101/408500

Systematic functional characterization of the intellectual disability-associated SWI/SNF complex reveals distinct roles for the BAP and PBAP complexes in post-mitotic memory forming neurons of the <i>Drosophila</i> mushroom body

2018· preprint· en· W2889929200 sur OpenAlexaff
Melissa C. Chubak, Max H. Stone, Nicholas Raun, Shelby L. Rice, Mohammed Sarikahya, Spencer Jones, Taylor A. Lyons, Taryn E. Jakub, Roslyn L. Mainland, Maria J. Knip, Tara N. Edwards, Jamie M. Kramer

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2018
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueChromatin Remodeling and Cancer
Établissements canadiensChildren’s Health Research InstituteWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMushroom bodiesBiologyMitosisChromatin remodelingCell biologyChromatinSWI/SNFGeneFunction (biology)NeuroscienceGeneticsDrosophila melanogaster

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Technology has led to rapid progress in the identification of genes involved in neurodevelopmental disorders like intellectual disability (ID), but our functional understanding of the causative genes is lagging. Here, we show that the SWI/SNF chromatin remodeling complex is one of the most overrepresented cellular components disrupted in ID. We systematically investigated the role of individual subunits of this large protein complex in post-mitotic memory forming neurons of the Drosophila mushroom body (MB). Using this approach, we have identified novel differential roles for the two prominent conformations of the Drosophila SWI/SNF complex, known as BAP and PBAP. The PBAP conformation is required post-mitotically for remodeling of the MB γ neurons during morphogenesis and is essential for both short and long-term memory. In contrast, the BAP conformation appears to preferentially effect long-term memory and is associated with γ neuron survival. Our results suggest that different subunits of the SWI/SNF complex may influence learning and memory through diverse and distinct roles in regulating structural plasticity, survival, and functionality of post-mitotic neurons. This study provides novel insight into the neuronal function of individual SWI/SNF subunits and will serve as a basis for understanding SWI/SNF-mediated gene regulatory mechanisms in post-mitotic neurons.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,698
Score d'incertitude au seuil0,815

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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