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Enregistrement W2889961404 · doi:10.1371/journal.pone.0203466

PPARα-mediated peroxisome induction compensates PPARγ-deficiency in bronchiolar club cells

2018· article· en· W2889961404 sur OpenAlexaff
Srikanth Karnati, Gani Oruqaj, Harshavardhan Janga, Srinu Tumpara, Claudia Colasante, Paul P. Van Veldhoven, Nancy Braverman, Adrian Pilatz, Thomas J. Mariani, Eveline Baumgart‐Vogt

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePeroxisome Proliferator-Activated Receptors
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Children's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPeroxisomePeroxisome proliferator-activated receptor gammaBiologyPeroxisome proliferator-activated receptorCell biologyTransfectionZellweger syndromeCell cultureChemistryBiochemistryReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Despite the important functions of PPARγ in various cell types of the lung, PPARγ-deficiency in club cells induces only mild emphysema. Peroxisomes are distributed in a similar way as PPARγ in the lung and are mainly enriched in club and AECII cells. To date, the effects of PPARγ-deficiency on the overall peroxisomal compartment and its metabolic alterations in pulmonary club cells are unknown. Therefore, we characterized wild-type and club cell-specific PPARγ knockout-mice lungs and used C22 cells to investigate the peroxisomal compartment and its metabolic roles in the distal airway epithelium by means of 1) double-immunofluorescence labelling for peroxisomal proteins, 2) laser-assisted microdissection of the bronchiolar epithelium and subsequent qRT-PCR, 3) siRNA-transfection of PPARγand PPRE dual-luciferase reporter activity in C22 cells, 4) PPARg inhibition by GW9662, 5) GC-MS based lipid analysis. Our results reveal elevated levels of fatty acids, increased expression of PPARα and PPRE activity, a strong overall upregulation of the peroxisomal compartment and its associated gene expression (biogenesis, α-oxidation, β-oxidation, and plasmalogens) in PPARγ-deficient club cells. Interestingly, catalase was significantly increased and mistargeted into the cytoplasm, suggestive for oxidative stress by the PPARγ-deficiency in club cells. Taken together, PPARα-mediated metabolic induction and proliferation of peroxisomes via a PPRE-dependent mechanism could compensate PPARγ-deficiency in club cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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