Isoflavonoid‐specific <i>prenyltransferase</i> gene family in soybean: GmPT01, a pterocarpan 2‐dimethylallyltransferase involved in glyceollin biosynthesis
Notice bibliographique
Résumé
Phytoalexin glyceollins are soybean-specific antimicrobial compounds that are derived from the isoflavonoid pathway. They are synthesized by soybean in response to extrinsic stress such as pathogen attack or injury, thereby conferring partial resistance if synthesized rapidly at the site of infection and at the required concentration. Soybean produces multiple forms of glyceollins that result from the differential prenylation reaction catalyzed by prenyltransferases (PTs) on either the C-2 or C-4 carbon of a pterocarpan glycinol. The soybean genome contains 77 PT-encoding genes (GmPTs) where at least 11 are (iso)flavonoid-specific. Transcript accumulation of five candidates GmPTs was increased in response to Phytophthora sojae infection, suggesting their role in phytoalexin synthesis. The induced GmPTs localize to plastids and display tissue-specific expression. We have in this study identified two additional GmPTs: an isoflavone dimethylallyltransferase 3 (IDT3); and a glycinol 2-dimethylallyl transferase GmPT01. GmPT01 prenylates (-)-glycinol at the C-2 position, localizes in the plastid, and exhibits root-specific gene expression. Furthermore, its expression is induced rapidly in response to stress, and is associated with a quantitative trait loci linked with resistance to P. sojae. Based on these results, we conclude that GmPT01 are possibly one of the loci involved in conferring partial resistance against stem and root rot disease in soybean.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».