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Enregistrement W2890074783 · doi:10.1200/jco.2016.34.15_suppl.e23134

Clinico-pathologic and molecular characteristics of patients with resected lung adenocarcinoma.

2016· article· en· W2890074783 sur OpenAlexaff
Mihaela Mates, Shuo Xu, Alexander H. Boag, Wilma M. Hopman, Harriet Feilotter

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLung Cancer Treatments and Mutations
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésKRASMedicineAdenocarcinomaMalignancyStage (stratigraphy)Internal medicineLung cancerMolecular pathologyLungOncologyAdjuvant therapyPathologyCancerGastroenterologyColorectal cancerGeneBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

e23134 Background: Lung adenocarcinoma (LA) is the most common lung malignancy. Recently, a novel histologic classification was recognized as a stage-independent predictor of survival. Furthermore, important molecular discoveries in the lung cancer genome have identified targetable driver mutations that led to new therapeutic interventions. The purpose of this study was to assess clinico-pathologic and molecular characteristics of patients with resected LA at our centre. Methods: Through pathology records we identified patients with resected LA between January 2005 - December 2008. We collected demographic, treatment, pathologic tumor characteristics and disease outcomes. Molecular analysis was undertaken to investigate genomic profile by next generation sequencing assays (NGS). Data were analyzed to determine associations between clinico-pathologic and molecular characteristics and disease outcomes (chi-square tests, independent samples t-tests and Mann-Whitney U). Results: We identified 121 eligible patients. Mean age: 65; 58% female; 7% nonsmokers; 81% lobectomy. Stage distribution: I – 64%, II – 20%, III – 16%. Histologic subtype: mucinous 9%; lepidic 11%; acinar 46%; solid 27%; micro/papillary 7%. Neo/adjuvant therapy – 35%. Of these patients we obtained DNA and RNA from 36 tumors and molecular analysis was successful on all samples. Genomic alterations results: KRAS – 55%; EGFR – 11%; p53 – 51%; MET 8%; RET – 6%; HER 2 – 3% BRAF – 3%; ALK and ROS – 0%. Five-year overall survival (OS) was 69%; by stage: I – 79%; II – 37%; III – 65%; by neo/adjuvant therapy (yes vs no): stage I – 85 vs 78%; II – 41 vs 29%; III – 50 vs 87%; by histologic subtype: mucinous – 82%; lepidic – 92%; acinar – 70%; solid/micro/papillary – 56%; by KRAS status: wild-type 75%, mutated 74%. Conclusions: In this predominantly smoking population with resected LA the most common histologic subtype was acinar; the proportion of KRAS-mutations was higher than the national average, and the incidence of RET rearrangements was higher than expected. In this small study significant OS benefit with neo/adjuvant therapy was seen in stage I and II LA but not stage III; no significant associations were found between histological subtypes and KRAS mutation status.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,449
Écart entre enseignants0,402 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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