A Data Science Approach to Predictive Analytic Research and Knowledge Translation
Notice bibliographique
Résumé
IntroductionCurrent approaches to the development and application of predictive studies is inefficient and difficult to reproduce. Thousands of predictive health algorithms have been developed; however, less than 2\% have been assessed outside their original setting and even fewer have been applied and evaluated in practice.
 Objectives and ApproachObjective: To develop a standardized workflow for algorithm development, dissemination and implementation.
 Existing predictive analytics workflow and open standards were adapted and expanded for health research and health care settings. The approach was designed to work within multidisciplinary teams and to improve research transparency, reproducibility, quality, efficiency and application. Key components include standardized algorithm description files, documentation and code libraries. All libraries and programming packages, which were created for/with open-source software, can be used for a wide range of statistical and machine learning models. Publicly-available repositories contain the algorithms, validation data, R code and other supporting infrastructure.
 ResultsAlgorithm development involves variable pre-specification and documentation of model variables, followed by creation of data preprocessing code to generate model variables from the study dataset. Preprocessing uses algorithm specification documentation and a function library, building upon and integrating with existing algorithms when possible to preventing code duplication. Models are output as a Predictive Modelling Markup Language (PMML) file, a portable industry standard for describing and scoring predictive models. A separate scoring "engine" is used to implement PMML-described algorithms in a range of settings, including algorithm validation at other research institutions. Algorithm applications currently include the Project Big Life (www.projectbiglife.ca) online calculators, population, health services and public health planning uses and an algorithm visualization tool. An API permits use of the calculator engine by other organizations.
 Conclusion/ImplicationsBarriers to the implementation of predictive analytics in real-world settings—such as within electronic medical records or decision aid applications—can be mitigated with well described algorithms that are easy to replicate and implement, especially as access to big health data increases and algorithms become increasingly complex.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,013 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,002 |
| Communication savante | 0,001 | 0,008 |
| Science ouverte | 0,005 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».