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Enregistrement W2890226403 · doi:10.1200/jco.2018.36.15_suppl.3089

Pelareorep to promote the expression of a IFN-gamma-related gene signature that predicts response to checkpoint blockade therapy.

2018· article· en· W2890226403 sur OpenAlexaff
Grey Wilkinson, Aine Piar, C. Resnyk, M. Jordan Humphrey, Keith Glendinning, Hue Tran, Romit Chakrabarty, Andres Gutierrez, Matthew Coffey

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInflammatory mediators and NSAID effects
Établissements canadiensOncolytics Biotech (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineTumor microenvironmentCancer researchGene signatureImmune checkpointImmunologyGene expressionBlockadeImmune systemImmunotherapyGeneBiologyReceptorInternal medicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

3089 Background: A clinical study in patients (pts) with metastatic breast cancer (mBC) treated with pelareorep resulted in significant improvements in overall survival. Clinical studies with checkpoint blockade inhibitors (CBIs) have also resulted in noteworthy clinical responses in a small subset of mBC pts. In pts who do not respond to CBIs, the absence of IFN-γ signalling in the tumor microenvironment has been proposed as a key mediator of innate resistance. IFN-γ signalling upregulates the expression of checkpoint ligands and promotes lymphocyte activation and infiltration to the tumor microenvironment. Thus, the expression of IFN-ɣ-related genes can be used to both facilitate and predict response to CBIs. Given pelareorep’s known capacity to promote an inflamed tumor phenotype, we hypothesised that pelareorep could also stimulate the expression of IFN-ɣ-related genes associated with response to CBIs. Methods: Cell lines derived from breast cancer (BC: MCF7, T47D, MD-231), colorectal cancer (CRC: HT-29, SW620), hepatocellular carcinoma, (HCC: SNU-387) and non-small cell lung cancer (NSCLC: H522) were infected with pelareorep at a multiplicity of infection equal to 50. We examined changes in gene expression and conducted cell viability assays at 6, 12, and 18 hours post-infection (including a non-infected control). To monitor changes in gene expression we employed a 780-gene panel (nanoString) to monitor for changes in the expression of key IFN-ɣ-related and other immunity-related genes. Results: All cell lines were susceptible to pelareorep induced cytopathic effect. Strikingly, BC and HCC cells lines significantly upregulated IFN-ɣ-related genes while CRC and NSCLC cell lines demonstrated only a modest and variable ability to promote IFN-ɣ pathway activation. Moreover, BC and HCC cells lines also upregulated key chemokines that are known to promote response to immunotherapy. Conclusions: These results suggest that various tumor types are amenable to immune priming for CBIs therapy with pelareorep. The role of pelareorep in the treatment of BC and HCC deserves further investigation, particularly in combination with other immunotherapies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,061
Tête enseignante GPT0,411
Écart entre enseignants0,350 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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