Molecular-based classification algorithm for endometrial carcinoma to categorize ovarian endometrioid carcinoma into prognostically significant groups.
Notice bibliographique
Résumé
e17081 Background: The Cancer Genome Atlas classification divides endometrial carcinoma in biologically distinct groups, and testing for p53, mismatch repair proteins (MMR) and polymerase ɛ (POLE) exonuclease domain mutations has been shown to predict the molecular subgroup and clinical outcome. While abnormalities in these markers have been described in ovarian endometrioid carcinoma (OEC), their role in predicting its molecular profile and prognosis is still not fully explored. Methods: OECs resected in a 14 year period were retrieved. Only tumors with confirmed endometrioid histology and negative WT1 were included. POLE mutational analysis and immunohistochemistry for p53, MLH1, MSH2, MSH6 and PMS2 was performed in formalin-fixed, paraffin-embedded tissue. Following the molecular classifier proposed for endometrial carcinoma ( B J Cancer 2015;113:299-310), cases were classified as: POLE mutated, MMR abnormal, p53 abnormal and p53 wild type. Clinicopathologic information was recorded including patient outcome. Results: 73 tumors were successfully reviewed and tested. Of these, 8 (11%) were POLE mutated, 6 (8%) were MMR abnormal and 17 (23%) were p53 abnormal; the remaining 42 cases (58%) were p53 wild type (no POLE, p53 or MMR abnormalities). Mean follow-up period was 69 months (median 62, range 1-179). The molecular classification was an independent predictor for disease free and overall survival on multivariate analysis (p = 0.005 and 0.045 respectively, Cox proportional hazard model). POLE mutated and MMR abnormal groups had 100% 5 year DFS and OS. p53 wild type cases had intermediate survival rates (86% DFS and OS). Conversely, the p53 abnormal group had worse outcomes with 42% DFS and 76% OS at 5 years. Conclusions: OEC can be classified into prognostically distinct subgroups by testing for molecular surrogates, akin to endometrial cancer. MMR and POLE alterations seem to identify a subset of ovarian endometrioid carcinomas with excellent outcome; conversely, abnormal p53 expression carries a worse prognosis. In the era of personalized medicine, the use of these markers in the routine evaluation of ovarian endometrioid tumors should be considered.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,006 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,006 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,007 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».