N-myristoyltransferase 2: A novel marker for colorectal cancer screening.
Notice bibliographique
Résumé
e15114 Background: Colorectal cancer (CRC) is the second most common cause of cancer related deaths in North America. Most CRCs arise from pre-malignant adenomatous polyps with some of these polyps developing into cancer over years providing an ideal opportunity for detection and intervention. However, the unpleasant nature of the current screening methods often leads to non-compliance. N-Myristoyltransferase (NMT) has been reported to be overexpressed in CRC tissues. In this study we show that NMT2, an isoform of NMT, is overexpressed in peripheral blood mononuclear cells (PBMC) of individuals with colorectal adenomatous polyps or cancers compared to healthy controls. Methods: PBMC’s were isolated from blood samples of CRC patients (n = 14), individuals with - non-adenomatous polyps (n = 8); adenomatous polyps (n = 18) and healthy controls (n = 24). Immunohistochemistry (IHC) was used to determine the NMT2 expression in these samples. IHC-scores were derived from assessment of both staining intensity (scale 0-3) and percentage of positive cells (0-100%), which were multiplied to generate an IHC -score between 0-300. Observers calculating the IHC scores were unaware of the polyp/CRC status. A receiver operating characteristic (ROC) analysis was performed to assess the overall performance of the NMT2 test via the area under the curve (AUC). Results: NMT2 was significantly overexpressed in PBMC of CRC patients (median IHC score- 196) compared to control subjects (median IHC score- 50). In addition, IHC scores were significantly higher for adenomatous polyps (median IHC score- 165) compared to those with non-adenomatous polyps (median IHC score- 54.8). We included non-adenomatous polyps and healthy subjects in “controls” and adenomatous polyps in “cases” along with CRC in the ROC analysis. The ROC curve of NMT2 expression displayed substantial separation between controls/non adenomatous polyps compared to CRC/adenomatous polyps [AUC = 0.913 (95% CI: 0.830-0.994)]. Conclusions: Our results show an increase in NMT2 expression in PBMC of CRC patients and individuals with adenomatous polyps suggesting that NMT2 could be used as a novel blood based biomarker for the screening and early detection of CRC. Validation studies are the next step.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».