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Enregistrement W2890237568 · doi:10.1101/413575

Role of PML-Nuclear Bodies in Human Herpesvirus 6A and 6B Genome Integration

2018· preprint· en· W2890237568 sur OpenAlexaff
Vanessa Collin, Annie Gravel, Benedikt B. Kaufer, Louis Flamand

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2018
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCytomegalovirus and herpesvirus research
Établissements canadiensUniversité LavalCentre hospitalier universitaire de Québec
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTelomereBiologyCRISPRGenomeGeneticsVirologyCell biologyDNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Human herpesviruses 6A and 6B (HHV-6A/B) are two betaherpesviruses that readily integrate their genomes into the telomeres of human chromosomes. To date, the cellular or viral proteins that facilitate HHV-6A/B integration remain elusive. In the present study, we demonstrate that the immediate early protein 1 (IE1) of HHV-6A/B colocalizes with telomeres during infection. Moreover, IE1 associates with PML-NBs, a nuclear complex that regulates multiples cellular mechanism including DNA repair and antiviral responses. Furthermore, we could demonstrate that IE1 targets all PML isoforms and that both proteins colocalize at telomeres. To determine the role of PML in HHV-6A/B integration, we generated PML knockout cell lines using CRISPR/Cas9. Intriguingly, in the absence of PML, the IE1 protein could still localize to telomeres albeit less frequently. More importantly, HHV-6A/B integration was impaired in the absence of PML, indicating that it plays a role in the integration process. Taken together, we identified the first cellular protein that aids in the integration of HHV-6A/B and shed light on this targeted integration mechanism. Author summary Human herpesviruses type 6A and 6B are relatively common viruses whose infections can be life threatening in patients with a compromised immune system. A rather unique feature of these viruses is their ability to integrate their genome in human chromosomes. Integration takes place is a specialized region of the chromosomes known as telomeres, a region that controls cellular lifespan. To date, the mechanisms leading to HHV-6A and HHV-6B integration remain elusive. Our laboratory has identified that the IE1 protein of HHV-6A and HHV-6B target the telomeres. Moreover, we have shown that IE1 associates with a cellular protein, PML, that is responsible for the regulation of important cellular mechanisms such as the life span of cells and DNA repair. Hence, we studied the role of PML in HHV-6 integration. Our study demonstrates that in absence of PML, the HHV-6A and HHV-6B integrate 50-70% less frequently. Thus, our study unveils the first cellular protein involved in HHV-6A and HHV-6 chromosomal integration.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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