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Enregistrement W2890255088 · doi:10.1158/1538-7445.prca2017-a079

Abstract A079: MicroRNA-139 regulates prostate cancer aggressiveness by targeting IGF1R

2018· article· en· W2890255088 sur OpenAlexaff
Yutaka Amemiya, Christopher J.D. Wallis, Tania Benatar, Elizabeth Kobylecky, Linda Sugar, Christopher Sherman, Robert K. Nam, Arun Seth

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related molecular mechanisms research
Établissements canadiensHealth Sciences CentreSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProstate cancerBiochemical recurrenceMedicineProstatectomyProportional hazards modelmicroRNAOncologyHazard ratioInternal medicineMetastasisCancerLymph nodeBiologyGeneConfidence interval

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background: Dysregulated microRNA (miRNA) expression has been implicated in prostate cancer progression. We previously identified a panel of five miRNAs associated with biochemical recurrence and metastasis following prostatectomy based on NGS-based whole miRNome discovery and qPCR-based validation analysis. In this analysis, we examine the effect of miR-139-5p, one of the downregulated miRNAs identified in the panel, in greater detail. Methods: Using a cohort of 585 patients treated with radical prostatectomy, we examined the prognostic significance of miR-139 (dichotomized around the median) using the Kaplan Meier method and Cox proportional hazard models. We validated these results using The Cancer Genome Atlas (TCGA) data. We created cell lines that overexpressed miR-139 for functional assays. Finally, we examined pathways through which miR-139 may function using prediction algorithms and confirmed targets by Western blotting and reporter assays. Results: MiR-139 downregulation was significantly associated with a variety of accepted prognostic factors in prostate cancer, including Gleason score, pathologic stage, margin positivity, and lymph node status. MiR-139 was associated with prognosis: the cumulative incidence of biochemical recurrence and metastasis was significantly lower among patients with high miR-139 expression (p=0.0004 and 0.038, respectively). After adjusting for known prognostic factors, patients with high miR-139 expression had significantly lower risk of recurrence (HR 0.77, 95% 0.58-1.04). Validation in the TCGA dataset showed a significant association between dichotomized miR-139 expression and biochemical recurrence (OR 0.52, 95% CI 0.33-0.82). Overexpression of miR-139 in PC3 and DU145 prostate cancer cells led to a significant reduction in cell proliferation and migration compared to control cells. IGF1R was identified as a potential target of miR-139 based on previous work in colorectal and non-small cell lung cancers. Reduced luciferase reporter activity was observed upon co-transfection of the 3′ UTR of IGF1Rβ with miR-139 mimic compared to co-transfection with control mimic. Furthermore, Western blotting of PC3 cells overexpressing miR-139 revealed reduced IGF1Rβ protein expression, as well as reduced expression of its downstream pathway proteins pAKT and pERK. Cell cycle analysis indicated a significantly increased number of cells arrested in G2/M phase in PC3 cells overexpressing miR-139. This was accompanied by an increase in β-galactosidase stained senescent cells and p21 protein expression. Conclusions: miR-139 is associated with improved prognosis in patients with localized prostate cancer. This appears to be mediated through an IGF1R pathway leading to increased p21 expression, resulting in prostate cancer cell senescence from G2 arrest. Citation Format: Yutaka Amemiya, Christopher J. Wallis, Tania Benatar, Elizabeth Kobylecky, Linda Sugar, Christopher Sherman, Robert Nam, Arun K. Seth. MicroRNA-139 regulates prostate cancer aggressiveness by targeting IGF1R [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference: Prostate Cancer: Advances in Basic, Translational, and Clinical Research; 2017 Dec 2-5; Orlando, Florida. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2018;78(16 Suppl):Abstract nr A079.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,372
Écart entre enseignants0,349 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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