A variant NuRD complex containing PWWP2A/B excludes MBD2/3 to regulate transcription at active genes
Notice bibliographique
Résumé
Transcriptional regulation by chromatin is a highly dynamic process directed through the recruitment and coordinated action of epigenetic modifiers and readers of these modifications. Using an unbiased proteomic approach to find interactors of H3K36me3, a modification enriched on active chromatin, here we identify PWWP2A and HDAC2 among the top interactors. PWWP2A and its paralog PWWP2B form a stable complex with NuRD subunits MTA1/2/3:HDAC1/2:RBBP4/7, but not with MBD2/3, p66α/β, and CHD3/4. PWWP2A competes with MBD3 for binding to MTA1, thus defining a new variant NuRD complex that is mutually exclusive with the MBD2/3 containing NuRD. In mESCs, PWWP2A/B is most enriched at highly transcribed genes. Loss of PWWP2A/B leads to increases in histone acetylation predominantly at highly expressed genes, accompanied by decreases in Pol II elongation. Collectively, these findings suggest a role for PWWP2A/B in regulating transcription through the fine-tuning of histone acetylation dynamics at actively transcribed genes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».