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Enregistrement W2890319494 · doi:10.1101/416008

Genome-wide association study of suicide attempt in psychiatric disorders identifies association with major depression polygenic risk scores

2018· preprint· en· W2890319494 sur OpenAlexaff
Niamh Mullins, Tim B. Bigdeli, Anders D. Børglum, Jonathan R. I. Coleman, Ditte Demontis, Ayman H. Fanous, Divya Mehta, Robert A. Power, Stephan Ripke, Eli A. Stahl, Anna Starnawska, Adebayo Anjorin, Aiden Corvin, Alan R. Sanders, Andreas J. Forstner, Andreas Reif, Anna C. Koller, Beata Świątkowska, Bernhard T. Baune, Bertram Müller‐Myhsok, Bettina Konte, Brenda W.J.H. Penninx, Carlos N. Pato, Clement C. Zai, Dan Rujescu, Digby Quested, Douglas F. Levinson, Elisabeth B. Binder, Enda M. Byrne, Esben Agerbo, Fabian Streit, Fermín Mayoral, Frank Bellivier, Franziska Degenhardt, Gerome Breen, Gunnar Morken, Gustavo Turecki, Guy A. Rouleau, Hans J. Grabe, Henry Völzke, Ina Giegling, Ingrid Agartz, Ingrid Melle, Jacob Lawrence, James B. Potash, James Walters, Jana Strohmaier, Jianxin Shi, Joanna Hauser, Joanna M. Biernacka, John B. Vincent, John R. Kelsoe, John S. Strauss, Jolanta Lissowska, Jonathan Pimm, Jordan W. Smoller, José Guzmán‐Parra, Klaus Peter Berger, Laura J. Scott, Maria Helena Pinto de Azevedo, Maciej Trzaskowski, Manolis Kogevinas, Marcella Rietschel, Marco P. Boks, Marcus Ising, Maria Grigoroiu‐Serbânescu, Marian L. Hamshere, Marion Leboyer, Mark A. Frye, Markus M. Nöthen, Martin Alda, Martin Preisig, Merete Nordentoft, Michael Boehnke, Michael O‘Donovan, Michael J. Owen, Michele T. Pato, Miguel E. Rentería, Monika Budde, Myrna M. Weissman, Naomi R. Wray, Nicholas Bass, Olav B. Smeland, Ole A. Andreassen, Ole Mors, Pablo V. Gejman, Pamela Sklar, Patrick J. McGrath, Per Hoffmann, Peter McGuffin, Phil H. Lee, René S. Kahn, Roel A. Ophoff, Rolf Adolfsson, Sandra Van der Auwera, Srdjan Djurovic, Stanley I. Shyn, Stefan Kloiber, Stefanie Heilmann‐Heimbach, Stéphane Jamain, Steven P. Hamilton, Susan L. McElroy, Susanne Lucae, Sven Cichon, Thomas G. Schulze, Thomas Folkmann Hansen, Thomas Werge, Tracy Air, Vishwajit L. Nimgaonkar, Vivek Appadurai, Wiepke Cahn, Yuri Milaneschi, Kenneth S. Kendler, Andrew McQuillin, Cathryn M. Lewis

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2018
Typepreprint
Langueen
DomainePsychology
ThématiqueSuicide and Self-Harm Studies
Établissements canadiensCentre for Addiction and Mental HealthTrinity College
Organismes subventionnairesNovo Nordisk FondenMinistry of Education, IndiaNovo NordiskUniversity of LouisvilleJohns Hopkins UniversityNational Institute of Mental HealthNorthwestern UniversityLundbeckfondenH. Lundbeck A/SRush UniversityWayne State UniversityStanley Medical Research InstituteNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekVrije Universiteit AmsterdamUniversity of Pennsylvania
Mots-clésMajor depressive disorderGenome-wide association studySuicide attemptMood disordersPsychiatryDepression (economics)Bipolar disorderSchizophrenia (object-oriented programming)MoodGenetic associationMedicinePsychiatric geneticsPsychologyClinical psychologyPoison controlSuicide preventionGenotypeGeneticsSingle-nucleotide polymorphismAnxietyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Objective Over 90% of suicide attempters have a psychiatric diagnosis, however twin and family studies suggest that the genetic etiology of suicide attempt (SA) is partially distinct from that of the psychiatric disorders themselves. Here, we present the largest genome-wide association study (GWAS) on suicide attempt using major depressive disorder (MDD), bipolar disorder (BIP) and schizophrenia (SCZ) cohorts from the Psychiatric Genomics Consortium. Method Samples comprise 1622 suicide attempters and 8786 non-attempters with MDD, 3264 attempters and 5500 non-attempters with BIP and 1683 attempters and 2946 non-attempters with SCZ. SA GWAS were performed comparing attempters to non-attempters in each disorder followed by meta-analysis across disorders. Polygenic risk scoring investigated the genetic relationship between SA and the psychiatric disorders. Results Three genome-wide significant loci for SA were found: one associated with SA in MDD, one in BIP, and one in the meta-analysis of SA in mood disorders. These associations were not replicated in independent mood disorder cohorts from the UK Biobank and i PSYCH. Polygenic risk scores for major depression were significantly associated with SA in MDD (P=0.0002), BIP (P=0.0006) and SCZ (P=0.0006). Conclusions This study provides new information on genetic associations and the genetic etiology of SA across psychiatric disorders. The finding that polygenic risk scores for major depression predict suicide attempt across disorders provides a possible starting point for predictive modelling and preventative strategies. Further collaborative efforts to increase sample size hold potential to robustly identify genetic associations and gain biological insights into the etiology of suicide attempt.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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