The Terry Fox Research Institute Canadian Prostate Cancer Biomarker Network: an analysis of a pan-Canadian multi-center cohort for biomarker validation
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Refinement of parameters defining prostate cancer (PC) prognosis are urgently needed to identify patients with indolent versus aggressive disease. The Canadian Prostate Cancer Biomaker Network (CPCBN) consists of researchers from four Canadian provinces to create a validation cohort to address issues dealing with PC diagnosis and management. METHODS: A total of 1512 radical prostatectomy (RP) specimens from five different biorepositories affiliated with teaching hospitals were selected to constitute the cohort. Tumoral and adjacent benign tissues were arrayed on tissue microarrays (TMAs). A patient clinical database was developed and includes data on diagnosis, treatment and clinical outcome. RESULTS: Mean age at diagnosis of patients in the cohort was 61 years. Of these patients, 31% had a low grade (≤6) Gleason score (GS), 55% had GS 7 (40% of 3 + 4 and 15% of 4 + 3) and 14% had high GS (≥8) PC. The median follow-up of the cohort was 113 months. A total of 34% had a biochemical relapse, 4% developed bone metastasis and 3% of patients died from PC while 9% died of other causes. Pathological review of the TMAs confirmed the presence of tumor and benign tissue cores for > 94% of patients. Immunohistochemistry and FISH analyses, performed on a small set of specimens, showed high quality results and no biorepository-specific bias. CONCLUSIONS: The CPCBN RP cohort is representative of real world PC disease observed in the Canadian population. The frequency of biochemical relapse and bone metastasis as events allows for a precise assessment of the prognostic value of biomarkers. This resource is available, in a step-wise manner, for researchers who intend to validate prognostic biomarkers in PC. Combining multiple biomarkers with clinical and pathologic parameters that are predictive of outcome will aid in clinical decision-making for patients treated for PC.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle