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Enregistrement W2890635845 · doi:10.1094/phyto-03-18-0101-r

Recombinase Polymerase Amplification Assay for Field Detection of Tomato Bacterial Spot Pathogens

2018· article· en· W2890635845 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevuePhytopathology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Pathogenic Bacteria Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of Food and Agricultural Sciences, University of FloridaHaramaya UniversityAgriculture and Agri-Food CanadaPennsylvania Department of AgricultureOhio State University
Mots-clésRecombinase Polymerase AmplificationBiologyPathogenMicrobiologyPolymerase chain reactionDetection limitMolecular biologyGeneGeneticsChemistryChromatography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bacterial spot of tomato is caused by Xanthomonas gardneri, X. euvesicatoria, X. perforans, and X. vesicatoria. Current diagnostic methods for the pathogens are not in-field assays. Recombinase polymerase amplification (RPA) is ideal for in-field detection assays, because it is an isothermal technique that is rapid and more tolerant to inhibitors compared with polymerase chain reaction. Hence, novel RPA probes and primers were designed to amplify regions of the hrcN gene of X. gardneri, X. euvesicatoria, and X. perforans. The X. gardneri RPA is specific to X. gardneri with a detection limit of 10 6 CFU/ml and detected X. gardneri in lesions from naturally (n = 6) or artificially (n = 18) infected plants. The X. euvesicatoria RPA detects both X. euvesicatoria and X. perforans with a detection limit of 10 6 CFU/ml and detected both pathogens in plants artificially infected (n = 36) or naturally infected (n = 85) with either X. euvesicatoria or X. perforans. The X. perforans RPA is specific to X. perforans with a detection limit of 10 7 CFU/ml. Although the X. perforans RPA assay was unable to detect X. perforans from lesions, the X. euvesicatoria RPA was successfully used in field to detect X. perforans from symptomatic field samples (n = 31). The X. perforans RPA was then used to confirm the pathogen in the laboratory. The X. euvesicatoria and X. gardneri RPA is promising for rapid, real-time in-field detection of bacterial spot and one of the first developed among plant pathogenic bacteria.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,093
Score d'incertitude au seuil0,238

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle