Linking Provincial and Prospective Cohort Study Data to Estimate the Incidence and Healthcare Burden of Viral Gastroenteritis
Notice bibliographique
Résumé
IntroductionAcute gastroenteritis (AGE) is a major cause of morbidity in children. While viruses are known to cause the largest proportion of illnesses, slow adoption of new technology and recommendations against routine testing have blunted our ability to estimate the impact of viral AGE on the health system. Objectives and ApproachOur objective was to quantify the incidence of medically-attended norovirus and other viral AGE etiologic agents as a baseline for future norovirus vaccination programs. AGE cases were identified through the Alberta Provincial Pediatric EnTeric Infection TEam (APPETITE) study, December 2014-December 2017, which tested participants for five viruses: rotavirus, norovirus, adenovirus, astrovirus, and sapovirus. Study data was linked to provincial health registry data to identify visits associated with the AGE episode. Comparable visits for children throughout the province were identified, and a comprehensive set of potential confounders was evaluated and used to standardize APPETITE rates to the Alberta population. ResultsAPPETITE received and tested specimens from 2,358 children with AGE presenting to the emergency department (ED) for care and 513 children with AGE whose parent or guardian called the provincial health advice line Health Link (HL). Norovirus was the most commonly detected pathogen, associated with 579 (24%) ED cases and 177 (19%) HL cases. After norovirus, the most common viruses were, in descending order: adenovirus (441 ED, 97 HL), rotavirus (408 ED, 88 HL), sapovirus (211 ED, 68 HL), and astrovirus (75 ED, 21 HL). Results for the incidence of viral AGE by etiologic agent, with the associated number of hospitalizations, ED visits, and primary care visits, will be available by the date of the IPDLN conference. Conclusion/ImplicationsBy linking data from APPETITE with the visit data available because of Alberta’s single-payer system, we are able to provide population-based estimates of disease incidence for viral AGE, as well as the burden on the health care system in terms of the number of visits associated with these viral illnesses.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,006 | 0,020 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,007 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».