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Enregistrement W2890903878 · doi:10.3389/fmicb.2018.02087

Recent Advances on the Multiplex Molecular Detection of Plant Viruses and Viroids

2018· review· en· W2890903878 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Microbiology · 2018
Typereview
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensCanadian Food Inspection Agency
Organismes subventionnairesMinisterio de Asuntos Económicos y Transformación Digital, Gobierno de EspañaGeneralitat Valenciana
Mots-clésMultiplexBiologyVirologyComputational biologyPlant virusGeneticsVirus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Plant viruses are still one of the main contributors to economic losses in agriculture. It has been estimated that plant viruses can cause as much as 50 billion euros loss worldwide, per year. This situation may be worsened by recent climate change events and the associated changes in disease epidemiology. Reliable and early detection methods are still one of the main and most effective actions to develop control strategies for plant viral diseases. During the last years, considerable progress has been made to develop tools with high specificity and low detection limits for use in the detection of these plant pathogens. Time and cost reductions have been some of the main objectives pursued during the last few years as these increase their feasibility for routine use. Among other strategies, these objectives can be achieved by the simultaneous detection and (or) identification of several viruses in a single assay. Nucleic acid-based detection techniques are especially suitable for this purpose. Polyvalent detection has allowed the detection of multiple plant viruses at the genus level. Multiplexing RT polymerase chain reaction (PCR) has been optimized for the simultaneous detection of more than 10 plant viruses/viroids. In this short review, we provide an update on the progress made during the last decade on techniques such as multiplex PCR, polyvalent PCR, non-isotopic molecular hybridization techniques, real-time PCR, and array technologies to allow simultaneous detection of multiple plant viruses. Also, the potential and benefits of the powerful new technique of deep sequencing/next-generation sequencing are described.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,993
Score d'incertitude au seuil0,300

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle