<i>SPAM1</i> and <i>PH-20</i> are two gene products expressed in bovine testis and present in sperm
Notice bibliographique
Résumé
Sperm adhesion molecule 1 (SPAM1) is a sperm protein possessing a hyaluronidase domain in its N-terminus and a zona pellucida-binding domain in its C-terminus. Our previous studies showed that bovine spermatozoa potentially have 2 SPAM1 isoforms that present different C-terminal domains, different origins (testis and epididymis) and different locations in spermatozoa. In this study, two approaches were taken to characterize the different SPAM1 isoforms. First, 3'-RACE experiments were done to determine the sequence of the 3' regions of the potential transcripts. Second, by in silico analyses, we aimed to determine whether our antibody that recognizes the N-terminal domain of SPAM1 detects two SPAM1 isoforms or two highly similar, although different, proteins. We found that the 3' regions of SPAM1 transcripts from bovine testis and caput epididymis were identical. Nevertheless, two transcript variants that differ by 90 nucleotides, encoded by an entire exon, are expressed in both tissues. Only the protein encoded by the longest SPAM1 transcript variant was confirmed in ejaculated bull spermatozoa by mass spectrometry. In silico analyses revealed a highly similar protein to SPAM1, PH-20, that could potentially be recognized by our N-terminal antibody. The presence of PH-20 transcripts was confirmed in bovine testis and the protein is present in ejaculated spermatozoa. Our N-terminal antibody possibly recognizes both SPAM1 and the highly homologous protein PH-20 instead of two SPAM1 isoforms. Identifying the proteins implicated in the fertilization process is crucial in order to elucidate their roles and to better understand the complex process of fertilization.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».